蛋白质相互作用网络的差分注释库

ppi-network-annotation的Python项目详细描述


利用差异表达基因构建蛋白质相互作用网络的文库 信息

输入文件

运行此程序需要4个文件:

  1. 蛋白质-蛋白质相互作用网络,格式为:

    Entrez IDEntrez IDConfidence score

    Such as:

    216 216 0.76

    3679 1134 0.73

    55607 71 0.65

    5552 960 0.63

    2886 2064 0.9

    5058 2064 0.73

    1742 2064 0.87

    An example of such a network can be found [here](http://cbdm-01.zdv.uni-mainz.de/~mschaefer/hippie/download.php)

  2. excel格式的实验文件。行显示单个条目,列是以下属性的值:

    • Log2 fold change
    • Adjusted p value
    • Entrez id

    The file may contain other columns too, but the indices and names of the above columns must be entered as parameters

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