蛋白质相互作用网络的差分注释库
ppi-network-annotation的Python项目详细描述
利用差异表达基因构建蛋白质相互作用网络的文库 信息
输入文件
运行此程序需要4个文件:
蛋白质-蛋白质相互作用网络,格式为:
Entrez IDEntrez IDConfidence score
Such as:
216 216 0.76
3679 1134 0.73
55607 71 0.65
5552 960 0.63
2886 2064 0.9
5058 2064 0.73
1742 2064 0.87
An example of such a network can be found [here](http://cbdm-01.zdv.uni-mainz.de/~mschaefer/hippie/download.php)
excel格式的实验文件。行显示单个条目,列是以下属性的值:
- Log2 fold change
- Adjusted p value
- Entrez id
The file may contain other columns too, but the indices and names of the above columns must be entered as parameters