一个轻量级的纯python包，用于读取、写入和操作wwpdb分发的mmcif文件
PDBeCif的Python项目详细描述
版权所有[2013]EMBL-欧洲生物信息学研究所
根据阿帕奇许可证2.0版（许可证）授权；您不得使用此文件，除非符合许可证。您可以在http://www.apache.org/licenses/license-2.0
http://www.apache.org/licenses/license-2.0
处获得
许可证的副本，除非适用法律要求或书面同意，
根据许可证分发的软件以"按原样"的方式分发，无任何明示或暗示的保证或条件。请参阅许可证中有关
特定语言的许可和限制
。
说明：[！[管道状态]（https://gitlab.com/glenveegee/pdbecif/badges/master/pipeline.svg）（https://gitlab.com/glenveegee/pdbecif/commits/master）
[！[覆盖率报告]（https://gitlab.com/glenveegee/pdbe cif/badges/master/coverage.svg）（https://gitlab.com/glenveegee/pdbecif/commits/master）
包
包含用于以不同方式访问mmcif数据的模块，具体取决于所需任务的类型。
通常的用法如下：
``python
from mmcifio import mmcifio
```
##从文件中读取：任何星型/cif/mmcif文件，输出：cif file对象```
```
参考：
nb：请参阅mmcif中的测试套件。测试以获取更多示例
\#列出所有data block对象ck（"block嫒3"）创建另一个空的datablock
cif嫒file.removeChild（data嫒block嫒2）覲删除datablock（方法1-给定对象）
cif嫒file.removeChild（"block嫒3"）覲删除datablock（方法2-给定ID）
打印"回收的datablocks:"，cif嫒file.recycle bin嫒删除的对象存储在回收站
```
#创建另一个空数据锁
data_block_5=cif_file.setdatablock（"block_5"）；创建另一个空的datablock
data_block_5.get id（）；获取datablock id
data_5.updateid（"block_5.1"）；更改datablock id
打印"类别id:"，data_block_1.get category ids（）；列出所有ca类别id
打印"类别对象："，data_block_1.getcategories（）；列出所有类别对象
category_1=data_block_1.getcategory（"_test_keyword"）；获取特定类别
category_2=data_block_4.setcategory（"category_2"）；创建空类别
category_3=data_block_4.setCategory（"category_3"）；创建空类别
data_block_4.removeChild（category_2）移除类别（方法1-给定对象）
data_block_4.removeChild（"category_3"）；移除类别（方法2-给定ID）
data_block_5.remove（）remove datablock from ciffile
打印"回收类别："，data_block_4.recycle bin已删除的对象存储在回收站
```
category_1=data_block_1.getcategory（"_test_keyword"）获取特定类别
category_4=data_block_4.setcategory（"category_4"）创建另一个空类别
category_5=data_4.setcategory（"category_5"）创建另一个空类别
打印"项目名称："，category_1.get item names（）；列出所有项目名称
打印"项目对象："，category_1.getitems（）；列出所有项目对象
item_1=category_1.getitem（"field_1"）；获取特定项目
item_2=category_4.setitem（"item_2"）；创建清空y item
item_3=category_4.setitem（"item_3"）创建空项
category_4.removeChild（item_2）移除项（方法1-给定对象）
category_4.removeChild（"item_3"）移除项（方法2-给定ID）
category_5.remove（）移除datablock中的category
打印"回收项目："，category_4.recycle bin移除的对象最终会出现在回收站中
````
设置一个特定项
item_4=category_4.setitem（"item_4"）；创建另一个空项
item_5=category_4.setitem（"item_5"）；创建另一个空项
打印"value（raw）："，item_1.getrawvalue（）；获取原始项值（方法1-使用访问器）
打印"value（raw）："，item_1.value获取原始项值（方法2-使用属性）
打印"value（formatted）："，item_1.getformattedvalue（）获取格式化值（用于文件导出）
item_4.setvalue（"value_2"）设置item value
item_5.setvalue（[9、8、7、6、5）设置项目值
项目5.remove（）；从类别中删除项目
打印"回收项目："，类别4.recycle bin；删除的对象最终会出现在回收站中setxxxx（）方法总是返回您试图设置的this。如果不存在对象，则创建一个新对象并返回它。
setxxxx（）因此既可以用作访问器，也可以用作赋值器
``python
安装
pip
pip install git+http://gitlab.com/glenveegee/pdbecif.git
例如：
pip install git+http://gitlab.com/glenveegee/pdbecif.git@v1.3.4
rm:Unknown
分类器：许可证：：OSI批准：：GNU通用公共许可证v3（GPLV3）
分类器：编程语言：：Python
分类器：编程语言：：Python：：2
分类器：编程语言：：Python：：2.6
分类器：编程语言：：Python：：2.7
classifier：编程语言：：python：：3
分类器：编程语言：：python：：3.2
分类器：编程语言：：python：：3.3
分类器：编程语言：：python：：3.4
分类器：编程语言：：python：：3.5
分类器：编程语言：：python：：：3.6
分类器：编程语言：：python：：3.7
分类器：编程语言：：python：：实现：：cpython
分类器：编程语言：：python：：实现：：pypypy
分类器：操作系统：：unix
分类器：操作系统：：macos
分类器：操作系统：：posix
分类器：预期受众：：科学/研究
分类器：预期受众：：开发人员
分类器：主题：：科学/工程：：生物信息学
根据阿帕奇许可证2.0版（许可证）授权；您不得使用此文件，除非符合许可证。您可以在http://www.apache.org/licenses/license-2.0
http://www.apache.org/licenses/license-2.0
处获得
许可证的副本，除非适用法律要求或书面同意，
根据许可证分发的软件以"按原样"的方式分发，无任何明示或暗示的保证或条件。请参阅许可证中有关
特定语言的许可和限制
。
说明：[！[管道状态]（https://gitlab.com/glenveegee/pdbecif/badges/master/pipeline.svg）（https://gitlab.com/glenveegee/pdbecif/commits/master）
[！[覆盖率报告]（https://gitlab.com/glenveegee/pdbe cif/badges/master/coverage.svg）（https://gitlab.com/glenveegee/pdbecif/commits/master）
包
包含用于以不同方式访问mmcif数据的模块，具体取决于所需任务的类型。
通常的用法如下：
``python
from mmcifio import mmcifio
```
##从文件中读取：任何星型/cif/mmcif文件，输出：cif file对象```
```
参考：
nb：请参阅mmcif中的测试套件。测试以获取更多示例
\#列出所有data block对象ck（"block嫒3"）创建另一个空的datablock
cif嫒file.removeChild（data嫒block嫒2）覲删除datablock（方法1-给定对象）
cif嫒file.removeChild（"block嫒3"）覲删除datablock（方法2-给定ID）
打印"回收的datablocks:"，cif嫒file.recycle bin嫒删除的对象存储在回收站
```
#创建另一个空数据锁
data_block_5=cif_file.setdatablock（"block_5"）；创建另一个空的datablock
data_block_5.get id（）；获取datablock id
data_5.updateid（"block_5.1"）；更改datablock id
打印"类别id:"，data_block_1.get category ids（）；列出所有ca类别id
打印"类别对象："，data_block_1.getcategories（）；列出所有类别对象
category_1=data_block_1.getcategory（"_test_keyword"）；获取特定类别
category_2=data_block_4.setcategory（"category_2"）；创建空类别
category_3=data_block_4.setCategory（"category_3"）；创建空类别
data_block_4.removeChild（category_2）移除类别（方法1-给定对象）
data_block_4.removeChild（"category_3"）；移除类别（方法2-给定ID）
data_block_5.remove（）remove datablock from ciffile
打印"回收类别："，data_block_4.recycle bin已删除的对象存储在回收站
```
category_1=data_block_1.getcategory（"_test_keyword"）获取特定类别
category_4=data_block_4.setcategory（"category_4"）创建另一个空类别
category_5=data_4.setcategory（"category_5"）创建另一个空类别
打印"项目名称："，category_1.get item names（）；列出所有项目名称
打印"项目对象："，category_1.getitems（）；列出所有项目对象
item_1=category_1.getitem（"field_1"）；获取特定项目
item_2=category_4.setitem（"item_2"）；创建清空y item
item_3=category_4.setitem（"item_3"）创建空项
category_4.removeChild（item_2）移除项（方法1-给定对象）
category_4.removeChild（"item_3"）移除项（方法2-给定ID）
category_5.remove（）移除datablock中的category
打印"回收项目："，category_4.recycle bin移除的对象最终会出现在回收站中
````
设置一个特定项
item_4=category_4.setitem（"item_4"）；创建另一个空项
item_5=category_4.setitem（"item_5"）；创建另一个空项
打印"value（raw）："，item_1.getrawvalue（）；获取原始项值（方法1-使用访问器）
打印"value（raw）："，item_1.value获取原始项值（方法2-使用属性）
打印"value（formatted）："，item_1.getformattedvalue（）获取格式化值（用于文件导出）
item_4.setvalue（"value_2"）设置item value
item_5.setvalue（[9、8、7、6、5）设置项目值
项目5.remove（）；从类别中删除项目
打印"回收项目："，类别4.recycle bin；删除的对象最终会出现在回收站中setxxxx（）方法总是返回您试图设置的this。如果不存在对象，则创建一个新对象并返回它。
setxxxx（）因此既可以用作访问器，也可以用作赋值器
``python
安装
pip
pip install git+http://gitlab.com/glenveegee/pdbecif.git
例如：
pip install git+http://gitlab.com/glenveegee/pdbecif.git@v1.3.4
rm:Unknown
分类器：许可证：：OSI批准：：GNU通用公共许可证v3（GPLV3）
分类器：编程语言：：Python
分类器：编程语言：：Python：：2
分类器：编程语言：：Python：：2.6
分类器：编程语言：：Python：：2.7
classifier：编程语言：：python：：3
分类器：编程语言：：python：：3.2
分类器：编程语言：：python：：3.3
分类器：编程语言：：python：：3.4
分类器：编程语言：：python：：3.5
分类器：编程语言：：python：：：3.6
分类器：编程语言：：python：：3.7
分类器：编程语言：：python：：实现：：cpython
分类器：编程语言：：python：：实现：：pypypy
分类器：操作系统：：unix
分类器：操作系统：：macos
分类器：操作系统：：posix
分类器：预期受众：：科学/研究
分类器：预期受众：：开发人员
分类器：主题：：科学/工程：：生物信息学
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