HiC图形的多样本变化检测
pareidolia的Python项目详细描述
Hi-C模式下的多样本变化检测
Pareidolia是一个从Hi-C图中检测模式强度变化的工具包。它可以用来比较不同条件下的样本,并使用多个重复来改进结果。在
这个工具箱利用chromosight的相关图,允许用相同的方法检测不同Hi-C模式(例如循环或边界)的变化。在
使用
api目前是WIP,将来将通过命令行界面公开。在
安装
Pareidolia在Pypi上可用,可以使用以下方式安装:
pip3 install --user pareidolia
- 项目
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