HiC图形的多样本变化检测

pareidolia的Python项目详细描述


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Hi-C模式下的多样本变化检测

Pareidolia是一个从Hi-C图中检测模式强度变化的工具包。它可以用来比较不同条件下的样本,并使用多个重复来改进结果。在

这个工具箱利用chromosight的相关图,允许用相同的方法检测不同Hi-C模式(例如循环或边界)的变化。在

使用

api目前是WIP,将来将通过命令行界面公开。在

安装

Pareidolia在Pypi上可用,可以使用以下方式安装:

pip3 install --user pareidolia

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