泛基因组的一种数据结构——基于成对序列相似性的单核和核心区识别

pancake的Python项目详细描述


pancake–用于pangenome分析的独立于注释的非数据库方法

pancake是一种非数据库方法,用于识别单核和核心区域。 在任意序列集中并且独立于注释数据。 基于成对序列相似性(由公共序列提供 对齐工具)pancake将pangenomes序列化为持久数据结构 提供进一步的分析和图形表示。 由于与编辑操作类似的子区域的顺序存储,存储要求 与纯序列数据相比,pancake的数据结构明显减少 (如fasta格式)。

版权所有(c)2013 Corinna Ernst<;corinna.ernst@uni-due.de>;(请参阅许可证)

欢迎加入QQ群-->: 979659372 Python中文网_新手群

推荐PyPI第三方库


热门话题
java缺少属性   java语言对米切尔最佳候选算法的改进   java How to fix“预期文件集合只包含一个文件,但它包含多个文件。”   java数组静态方法返回sum,但不返回任何内容   java桌面应用程序的netbeans报告   使用Hibernate的java表删除不起作用   使用多部分实体上载java图像错误   java协同程序不会在包含它的服务停止时停止   java Struts验证错误:“尝试获取布尔值时得到的结果为null”   我可以使用一个for循环将位转换成一个整数,该循环在Java中迭代8次以获得8位的数字吗?   java无法使用bin/cassandra f启动cassandra   java Jsoup html解析   java自连接Jpa注释   JDK8中的java动态数组   java与嵌入式Tomcat 8共享类加载器