ebi本体查找服务restful api的python客户机

ols-client的Python项目详细描述


用于访问本体查找服务的restful api的python包装器

安装

从pypi安装最新的稳定版本

$ python3 -m pip install ols_client

直接从github安装最新版本

$ python3 -m pip install git+https://github.com/cthoyt/ols-client.git

食谱

从本体获取标签

>>> from ols_client import get_labels
>>> labels = get_labels('chebi')

使用替代ols从本体获取标签

>>> from ols_client import get_labels
>>> labels = get_labels('chebi', ols_base='http://lookup.scaiview.com/ols-boot/api/')

使用cli

$ python3 -m ols_client labels chebi > chebi.txt

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