神经元包管理器
nrn-glia的Python项目详细描述
神经胶质细胞：神经元程序包管理器
胶质细胞是神经元的资产管理器。它从 不同的pip包并将它们编译到一个中央库中 自动加载到神经元中。这样就不需要编译了 文件夹一个又一个文件夹与杂乱，重复的mod文件，并允许你 集中精力在多个模型中使用这些机制。在
将mod文件打包为Glia包允许您分发它们 作为Python模型的依赖项并委托安装， 将资产分发、版本控制和归档到Python的包中 皮普经理。在
要创建Glia包，请查看CLI工具 Astrocyte。星形胶质细胞 允许你组织你的个人mod收集！在
使用
Glia可从pip安装：
pip install nrn-glia
Glia将检查包是否已添加、更改或删除，以及 如果需要，将重新编译并加载库。这意味着除了 进口Glia没什么需要做的！在
^{pr2}$Glia避免了作者之间的冲突，甚至是同一作者的变体 机制，并允许您在许多 级别：全局、每个脚本、每个上下文或每个函数调用。在
资产管理
Glia允许多个资产引用同一机制 每个包都有一个唯一的名称。标准命名约定如下 以下内容：
glia__<package-name>__<asset-name>__<variant-name>
包、资产或变量名称中不允许使用双下划线。在
此命名约定允许多个人提供
实现相同的资产，并通过使用变体甚至一个包
可以在同一机制上提供多种变体。违约
变量是0
如果您安装了多个提供相同资产的软件包，或者 想指定另一种变体，你需要告诉Glia 一个你需要的。可以通过设置资源首选项来执行此操作。在
资产首选项
提供资产首选项有4个不同的范围：
- Global scope:选择一个默认的机制资产。在
- Script scope:为 Python脚本的其余部分。在
- Context scope:为所有人选择一个首选包或变体
glia.insert在上下文块中调用。在 - Single use:为单个
glia.insert选择一个机制资产 呼叫
一次性使用
每当您调用glia.insert时，您都可以为此附加您的首选项
插入：
g.insert('Kv1',pkg='not_my_models',variant='high_activity')
上下文范围
with语句中的任何glia.insert或glia.resolve调用都将
最好使用给定的软件包或变体：
frompatchimportps=p.Section()withg.context(pkg='not_my_models'):g.insert(s,'Kv1')g.insert(s,'Kv1',variant='high_activity')
还可以指定具有多个特定于资产的首选项的词典：
frompatchimportps=p.Section()withg.context(assets={'Kv1':{'package':'not_my_models','variant':'high_activity'},'HCN1':{'variant':'revised'}}):g.insert(s,'Kv1')g.insert(s,'HCN1')# Not affected by the context:g.insert(s,'Kir2.3')
你甚至可以组合，更喜欢某个包，除非 字典另有规定：
frompatchimportps=p.Section()withg.context(assets={'Kv1':{'package':'not_my_models','variant':'high_activity'},'HCN1':{'variant':'revised'}},package='some_pkg_name'):g.insert(s,'Kv1')g.insert(s,'HCN1')
最后，对于那些有着疯狂偏好的人，你甚至可以 嵌套上下文，其中最里面的首选项优先。在
脚本作用域
使用glia.select选择一个首选机制资产，类似于
在glia模块的剩余生命周期内，一次性使用语法：
section_global_Kv1=h.Section()section_local_Kv1=h.Section()g.insert(section_global_Kv1,'Kv1')# Will use your global Kv1 mechanismg.select('Kv1',pkg='not_my_models',variant='high_activity')g.insert(section_local_Kv1,'Kv1')# Will use the above selected Kv1 mechanism
全球范围
应用全局范围使用Glia命令行工具并将配置 glia总是选择机制资产作为默认资产。在
转到您最喜欢的命令行并输入：
glia select Kv1 --pkg=some_pkg_name --variant=non_default
这将在您使用的任何脚本中设置首选项。在
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