python中fmri数据的建模与统计分析

nistats的Python项目详细描述


NISTATS

nistats是一个python模块,用于快速方便的建模和统计分析 功能磁共振成像数据。

它利用nilearnpython工具箱 神经影像数据处理(数据下载、可视化、掩蔽)。

这项工作由 community的 其中包括INRIA顶楼项目组和D'Esposito实验室 伯克利。

它是基于NIPY的发展 nipy项目。

依赖关系

使用软件所需的依赖项为:

  • python=2.7
  • 设置工具
  • numpy=1.11
  • scipy=0.17
  • 尼伯贝尔=2.0.2
  • 零收入=0.4.0
  • 熊猫>;=0.18.0
  • sklearn=0.18.0
  • patsy=0.4.1

如果使用nilearn绘图功能或运行 例如,matplotlib>;=1.5.1是必需的。

如果要运行测试,则需要nose>;=1.2.1和coverage>;=3.7。

如果要下载OpenNeuro数据集,需要Boto3>;=1.2

安装

要执行安装,请从nistats目录运行以下命令:

python setup.py install --user

开发

代码

吉特

您可以使用以下命令检查最新的源代码:

git clone git://github.com/nistats/nistats

或者如果您有写权限:

git clone git@github.com:nistats/nistats

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