python中fmri数据的建模与统计分析
nistats的Python项目详细描述
NISTATS
nistats是一个python模块,用于快速方便的建模和统计分析 功能磁共振成像数据。
它利用nilearnpython工具箱 神经影像数据处理(数据下载、可视化、掩蔽)。
这项工作由 community的 其中包括INRIA顶楼项目组和D'Esposito实验室 伯克利。
它是基于NIPY的发展 nipy项目。
重要链接
- 官方源代码回购:https://github.com/nistats/nistats/
- HTML文档(稳定版本):http://nistats.github.io/
依赖关系
使用软件所需的依赖项为:
- python=2.7
- 设置工具
- numpy=1.11
- scipy=0.17
- 尼伯贝尔=2.0.2
- 零收入=0.4.0
- 熊猫>;=0.18.0
- sklearn=0.18.0
- patsy=0.4.1
如果使用nilearn绘图功能或运行 例如,matplotlib>;=1.5.1是必需的。
如果要运行测试,则需要nose>;=1.2.1和coverage>;=3.7。
如果要下载OpenNeuro数据集,需要Boto3>;=1.2
安装
要执行安装,请从nistats目录运行以下命令:
python setup.py install --user
开发
代码
吉特
您可以使用以下命令检查最新的源代码:
git clone git://github.com/nistats/nistats
或者如果您有写权限:
git clone git@github.com:nistats/nistats