用python分析复杂网络

netsci的Python项目详细描述


netsci

用python分析复杂网络

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netsci是一个python包,用于对空间嵌入式网络进行有效的统计分析。此外,它还提供了motif计数算法的有效实现。 对于其他模型和度量,我们强烈建议使用现有的和更丰富的工具。值得注意的包是华丽的NetworkXgraph-toolBrain Connectivity Toolbox

简单示例

分析星形网络(四个节点)

>>>importnumpyasnp>>>importnetsci.visualizationasnsv>>>A=np.array([[0,1,1,1],[0,0,0,0],[0,0,0,0],[0,0,0,0]])>>>nsv.plot_directed_network(A,pos=[[0,0],[-1,1],[1,1],[0,-np.sqrt(2)]])

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>>>importnetsci.metrics.motifsasnsm>>>f=nsm.motifs(A,algorithm='brute-force')>>>print(f)[1000030000000000]
>>>nsv.bar_motifs(f)

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测试

安装后,您可以启动测试套件:

$ pytest

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