基于web的NEST模拟器GUI应用
nest-desktop的Python项目详细描述
嵌套桌面
用于NEST simulator的交互式桌面应用程序
简介
在过去的几年里,我们开发了一个基于web的图形用户界面(GUI),用于NEST桌面的NEST模拟代码。这个图形用户界面可以快速构建、参数化和仪器化神经元网络模型,这些模型通常用于计算神经科学。同时,我们需要一个非神经科学的工具来快速开发一个有趣的非语言控制工具。在
到目前为止,我们已经在弗莱堡大学的两门课程中非常成功地使用了NEST Desktop,面向具有不同背景的学士、硕士和研究生阶段的学生,包括生物学、物理、计算机科学和电气工程(神经元和网络的单神经元建模和生物物理学)。NEST Desktop取代了我们多年使用的Mathematica笔记本电脑。使用新工具,我们观察到学习进度比以前快得多,并且对学生有很强的激励作用。在
目前,NEST Desktop要求NEST服务器具有完整的NEST安装,这限制了非专家用户的使用,并将所研究的网络限制为可以在笔记本电脑上模拟的网络。为了简化NEST桌面的使用和NEST Desktop可能的模拟范围,我们希望将GUI从模拟内核中分离出来,在用户的web浏览器中呈现GUI,同时模拟内核运行在一个集中维护的服务器上。在
设置
要安装NEST Desktop:
pip3 install nest-desktop
用法
要启动NEST Desktop:
^{pr2}$或者,要在Python接口中启动NEST服务器(例如IPython、Jupyter):
from nest_desktop import app
app.run(host='127.0.0.1', port=5000)
使用此链接打开web浏览器http://127.0.0.1:8000。在
故障排除
随着版本升级,某些配置或数据库可能不兼容。 有时重置配置或数据库时会有所帮助。如果没有,则清除浏览数据。在
许可证MIT
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