位点饱和突变数据处理、分析和可视化软件包
mutagenesis-visualization的Python项目详细描述
突变可视化 [![维护]（https://img.shields.io/badge/maintained%3F-yes-brightgreen.svg)](https://github.com/fhidalgor/mutagenesis_visualization/graphs/commit-activity） [![文档状态]（https://readthedocs.org/projects/mutagenesis-visualization/badge/?version=latest)](https://mutagenesis-visualization.readthedocs.io/en/latest/？徽章=最新） [![生成状态]（https://travis-ci.org/fhidalgor/mutagenesis_visualization.svg?branch=master)](https://travis-ci.org/fhidalgor/mutagenesis_visualization） [![codecov]（https://codecov.io/gh/fhidalgor/mutagenesis_visualization/branch/master/graph/badge.svg?token=QEAHI2DQDE)](https://codecov.io/gh/fhidalgor/mutagenesis_visualization） [![PyPI版本]（https://badge.fury.io/py/mutagenesis-visualization.svg)](https://badge.fury.io/py/mutagenesis-visualization） [![许可证：GPL v3]（https://img.shields.io/badge/License-GPLv3-brightgreen.svg)](https://www.gnu.org/licenses/gpl-3.0） [![活页夹]（https://mybinder.org/badge_logo.svg)](https://mybinder.org/v2/gh/fhidalgor/mutagenesis_visualization/HEAD?filepath=mutagenesis_visualization%2Ftutorial%2F）
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概述 突变_可视化是一个Python包，旨在为位点饱和突变数据集生成出版质量图。在
包的主要功能是执行管道的统计分析和可视化步骤，但它还提供了从FASTQ文件计算扩展分数的工具。在
主要特点
- 从FASTQ文件计算扩展分数，允许不同的数据处理和标准化方法。在
- 从丰富的分数以及大量的可视化绘图中生成出版质量的热图。在
- 主成分分析（PCA）、层次聚类和接收器工作特性（ROC）曲线工具。在
- 使用Pymol将富集分数轻松映射到PDB结构上。可以使用sasb中的结构因子a或从sasb中提取结构因子。在
工作流
啊！[工作流]（/docs/\u static/Workflow_v3.png）
##安装
通过执行以下操作，可以从PyPI安装突变可视化：
` pip install mutagenesis_visualization `
如果您喜欢从Github安装，请使用：
` pip install git+https://github.com/fhidalgor/mutagenesis_visualization `
###文件
您可以在[这里]找到文档（https://mutagenesis-visualization.readthedocs.io/en/latest/）。在
##教程
在“突变”可视化/教程文件夹中有7本jupyter笔记本，它们详细介绍了如何使用该软件。你可以通过[mybinder]（https://mybinder.org/v2/gh/fhidalgor/mutagenesis_visualization/HEAD?filepath=mutagenesis_visualization%2Ftutorial%2F）在线玩它们，而不必下载任何东西。在
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