磁共振实验模拟器及可视化工具。

mrsprint的Python项目详细描述


MRSPRINT

PyPI VersionDocumentation Status

欢迎!

磁共振实验模拟器和可视化工具

mrsprint是一个可视化的磁共振模拟器,你可以在这里模拟 核磁共振实验-光谱学或成像。它的主要目标是 成为帮助学生/员工理解的教育工具, 解释和探索磁共振现象。

这个工具是完全免费的(见许可证),但是如果你正在使用它, 你需要用两个引文来引证我们。这对我们很重要。

  • 文章:马上就来!
  • 软件:马上就来!

如果你用这个软件生成图像,gif,电影, 等,或使用本网站提供的图片,请也参考我们 使用那些引文。

你能看到什么?

  • 进动:静磁场中的自旋进动;
  • 共振:施加射频脉冲时的共振;
  • 对比度:T1、T2和自旋密度;
  • 场不均匀性:等色系可以用其色散来表示;
  • 梯度:磁场的作用梯度,其强度和对频率的影响;
  • 演化:过磁化强度、频率、相位和脉冲序列;
  • 自由感应衰减,信号;
  • 回声:自旋或梯度回声(重相/退相)。

未来规划功能

  • K空间可视化;
  • 多核样品/实验;
  • t2*作为采样参数,可轻松设置场的不均匀性;
  • 图形序列编辑器;
  • 化学相互作用;
  • 坐标实验室系统视图;
  • 流动(旋转位置不固定)。

文件

Go to documentation on ReadTheDocs! 它可以在阅读html、epub和pdf格式的文档时使用。

下载二进制文件-单击并运行

二进制文件是为那些不想安装任何python的东西。 我们推荐给那些没有编程经验的人。 从下面的链接下载。

  • 便携式Windows二进制文件:即将推出!
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你可以下载,解压,点击运行。

从pypi安装-稳定,最终用户

要安装,请执行

$ pip install mrsprint

这将安装所有必需的依赖项,然后安装代码。

从终端运行

$ mrsprint

依赖性

  • numpy:数值数学库;
  • 科学图书馆;
  • nmrglue:nmr处理库;
  • h5py:存储和管理数据文件;
  • pyqtgraph:数据可视化库;
  • pyqt/pyside:图形框架。

使用上述方法时,将自动安装依赖项。

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