基因组数据模拟器
mitt的Python项目详细描述
Mitty是一个数据模拟器,旨在帮助调试校准器和变量 打电话的人。
它需要Python3.4或更高版本。它是在 Apache2.0许可证。
功能
- 从整个基因组、单个微小区域或 根据需要设置区域
- 如果vcf-gt域是 正确设置
- 读取qname存储正确的pos、雪茄和变型的大小 包含在阅读内容中
- 所读样本名称,允许我们从
不同的模拟/源
- 可将病毒污染混入读数中
- 可进行肿瘤/正常混合
- 损坏模块将顺序错误添加到读取中
- 可以从现有的BAM文件 中读取读取模型
- “上帝校准器”写出了一个BAM与完美的校准器,可以是 用于BAM比较
- 利用snps和different生成vcf的简单基因组模拟器 对齐器/呼叫者测试的插入和删除大小
- 使用可组合的分析功能分析、绘制和调试对齐精度
教程和使用手册可以找到here。