荧光素酶数据的辅助函数
luciferase的Python项目详细描述
荧光素酶
绘制荧光素酶报告器数据的工具。感谢邱文华和冲绳美林的启发和贡献。
安装
pip3 install luciferase
或
pip3 install --user luciferase
条形图的命令行界面
一个名为luciferase-barplot的脚本，用于从json格式创建条形图
包括数据。安装luciferase之后，您可以这样使用它：
luciferase-barplot --title "plot title" example.json example.pdf
另请参见帮助消息：
luciferase-barplot -h
json格式的luciferase报告器数据示例：
{"Non-risk, Fwd":[8.354,12.725,8.506],"Risk, Fwd":[5.078,5.038,5.661],"Non-risk, Rev":[9.564,9.692,12.622],"Risk, Rev":[10.777,11.389,10.598],"Empty":[1.042,0.92,1.042]}
{"Alt, MIN6":[5.47,7.17,6.15],"Ref, MIN6":[3.16,3.04,4.34],"Empty, MIN6":[1.07,0.83,0.76],"Alt, ALPHA-TC6":[2.50,3.47,3.33],"Ref, ALPHA-TC6":[2.01,1.96,2.31],"Empty, ALPHA-TC6":[1.042,0.92,1.042]}
输入json应该包含五个条目或六个条目。如果它包含 五个条目，生成的绘图条将具有2-2-1样式。如果它 包含六个条目，条将具有2-1-2-1样式。
显著性指标将写在横线上方：***如果p<；0.001，
**如果p<；0.01，*如果p<；0.05，ns否则。
下面是2-1-2-1样式的绘图示例：
欢迎加入QQ群-->： 979659372
