检测图表中的所有超级气泡。

LSD-Bubble的Python项目详细描述


线性超气泡探测器

https://raw.githubusercontent.com/Fabianexe/Superbubble/master/logo.png

简介

本计画提供线性超级气泡侦测器(LSD)的参考实作。

功能

  • 在线性时间内检测超级气泡
  • 使用NetworkX作为图形库
  • 可以加载大量的文件格式(所有NetworkX can load
  • 有不同的方法报告超级气泡
  • 简单明了的代码
  • 易于理解和重新实现

文档

文档可在以下位置找到: https://fabianexe.github.io/Superbubble

安装

简单的安装方法是使用pip:

pip install LSD-Bubble

您还可以从https://github.com/Fabianexe/Superbubble下载源代码并运行make脚本来安装包。 需要安装setuptools

使用量

程序只需要一个指向图形文件的路径就可以工作,并且它应该使用的算法:

lsd d path

如果需要其他检测算法,请尝试:

lsd p path

lsd o path

如果输入格式未使用edgelist,请使用-f参数给出格式

lsd d path -f gml

如果需要其他报告格式,请使用-r

lsd d path -r count

如果您不想检测超级气泡,但要使用“周”超级气泡–周:

lsd d path –week

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