低水平核酸序列操作工具
libnano的Python项目详细描述
libnano是beta版的
核酸工具包
用于处理dna序列的低级python模块
它的开发目的是在特定于应用程序的库中用作COG，同时避免膨胀。<；br/>；
目标是要快，所以大多数东西都是用cython或c写的。
该项目正在积极开发中，希望文档很快就能完成
Python3.6+现在只为cython输入代码基，为python代码输入提示
功能
- seqstr：反向补码和汉明距离查找器
- seqgraph：查找兼容序列的团
- sequint：将小于32个碱基的序列转换为二进制
- seqscreen：根据gc内容等过滤序列
- ensembl rest：使用ensembl rest api查找基因和转录本 信息
- prostr：将dna转换为rna再转换回aa
- 条形码工具：生成具有长度和汉明距离的dna条形码集 限制
- seqsearch：搜索限制站点或 “Submers”（与目标中的子序列不匹配的Kmers为0或更多）
- fileio：genbank和fasta读写器，xmfa
- seqrecord：替代biopython seqrecord的功能较少
安装
如果您想在本地python环境中安装libnano 您可以使用pip：
$ pip install libnano
或者从github的源代码构建repo
$ python setup.py install
欢迎加入QQ群-->： 979659372
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