用于运行Galaxy工作流的命令行工具。
gflow的Python项目详细描述
[！[生成状态]（https://travis-ci.org/AAFC-MBB/GFlow.svg?branch=master)](https://travis-ci.org/AAFC-MBB/GFlow） gflow公司 ==
](https://travis-ci.org/AAFC-MBB/GFlow){kind=link}
这是一个命令行界面应用程序，允许在配置文件中指定数据集和工作流，然后在galaxy实例上执行工作流。
安装
从源目录：
$ pip install -r requirements.txt $ python setup.py install
配置
在config/中复制示例配置文件，并根据需要设置其中的参数：
$ cp config/config.yml.sample config/config.yml
用法
然后，执行：
$ gflow config/config.yml
或者，如果在未安装工具的情况下从源目录执行：
$ export PYTHONPATH=$PYTHONPATH:$PWD $ ./scripts/gflow config/config.yml
测试
出于测试目的，data/和workflow/中包含了少量数据文件和工作流文件。 设置`GALAXY_URL`和`GALAXY_API_KEY`环境变量后，使用以下命令执行测试：
$ python setup.py test
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