通用遗传学/基因组学实用程序。
genetools的Python项目详细描述
基因工具：单细胞分析配方（正在进行中）
绘图库
其他特性
- 通过计算共聚类百分比来比较聚类结果。在
- 根据参考列表绘制标记基因，以找到集群的名称。在
- 熊猫喷枪：
- 方便地拆分单个单元格条码。在
- 具有严格正确性检查的防御性熊猫合并和连接方法。在
完整文档：https://genetools.maximz.com。在
安装
运行pip install --upgrade 'genetools[scanpy]'。在
或者如果不使用scanpy:pip install --upgrade genetools。在
使用
要在项目中使用genetools，请添加import genetools。查看documentation和{a10}的示例。在
发展
设置：
git clone git://github.com/maximz/genetools
cd genetools
pip install -r requirements_dev.txt
pre-commit install
常用命令：
^{pr2}$竞争对手：
变更日志
0.4.0
- Cite-seq蛋白质数据的中心对数比（CLR）标准化。在
0.3.0（2020-06-03）
- 熊猫助手更容易正常化
0.2.0（2020-06-03）
- 更快地实现
stats.coclustering - 介绍
helpers.make_slurm_command - 全局子模块导入（不再需要单独导入子模块）
0.1.0（2020-03-06）
- PyPI的第一个版本。在
- 项目
标签：
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