fmriprep是一个健壮且易于使用的管道，用于各种fmri数据的预处理。
fmriprep的Python项目详细描述
功能性磁共振成像（fmri）的预处理包括许多步骤来进行清理和标准化。 统计分析前的数据。 通常，研究人员会为每个数据集创建特殊的预处理工作流， 建立在大量可用工具的基础上。 这些工作流程的复杂性在迅速发展中雪上加霜。 采集和处理。 fmriprep是一个分析不可知的工具，它解决了健壮性和 任务型和静息型fmri数据的可重复预处理。 fmriprep自动调整最佳工作流以适应 几乎任何数据集，确保无需人工干预的高质量预处理。 fmriprep在不同的fmri数据上产生了高质量的结果。 此外，fmriprep引入的不受控制的空间平滑度比观察到的要小 使用常用的预处理工具。 fmriprep为神经科学家提供了一个易于使用和透明的预处理 工作流，有助于确保推理的有效性和可解释性 结果。
工作流基于Nipype并编码一个 一套来自著名的神经成像软件包的工具，包括 FSL， ANTs， FreeSurfer， AFNI， 还有Nilearn。 此管道旨在为 预处理，并将随着更新和更好的神经成像软件而更新 可用。
fmriprep执行基本的预处理步骤（coregistration、normalization、unwarping、noise 组件提取、分割、头盖骨剥离等）提供 容易提交到各种组级分析，包括基于任务或静止状态 功能磁共振成像、图论测量、基于表面或体积的统计等。 fmriprep允许您轻松地执行以下操作：
- Take fMRI data from unprocessed (only reconstructed) to ready for analysis.
- Implement tools from different software packages.
- Achieve optimal data processing quality by using the best tools available.
- Generate preprocessing-assessment reports, with which the user can easily identify problems.
- Receive verbose output concerning the stage of preprocessing for each subject, including meaningful errors.
- Automate and parallelize processing steps, which provides a significant speed-up from typical linear, manual processing.
[新方法：10.1038/s41592-018-0235-4] [文档fmriprep.org] [软件doi:10.5281/zenodo.852659] [支持neurostars.org]
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