用于python的firebrowse门户api绑定

firebrowse的Python项目详细描述


说明

FireBrowse:Broad Institute TCGA GDAC FireBrowse门户的Python绑定。

此模块有助于与TCGA数据进行编程交互,并在 firebrowse.org,通过python和unix命令行。它提供3套 功能:

1)底层面向对象的python包装器到firebrowse restful api。 默认情况下,低级接口中的方法返回每个 以json形式调用。tsv、csv和python dict可以通过指定 合适的格式=参数,可以使用合适的 page=参数。有关详细信息,请参见set_codec()和param_values()函数 有关这些参数和其他参数的详细信息。

2)一个更高级别的python接口,为公共 生物信息用例。例如,对象不需要显式地 在默认情况下,实例化和函数根据 以TSV格式调用。

3)和FBGET工具,用于直接从 unix命令行。

有关详细信息、文档和示例,请参见

https://confluence.broadinstitute.org/display/GDAC/fbget

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