fastsl-py算法是一种在基因组代谢模型中识别合成致死基因/反应集的有效算法。
fastsl的Python项目详细描述
这是fastsl的python实现,它是 基因组规模代谢中合成致死基因/反应集的鉴定 模型。
此包基于 cobrapy并提供了一个简单的 命令行工具。
有关文档,请访问:http://fastsl py.readthedocs.io
基本要求:
- Python 3.6 for Gurobi 8 - Python 3.5 for IBM CPLEX and Gurobi 7
安装:
使用pip从pypi安装(建议在虚拟环境中安装):
pip install fastsl
贡献:
- 问题跟踪器:<;https://github.com/ramanlab/fastsl py/issues>;
支持:
如果你有问题,请告诉我们。 联系我们:<;fast-sl@ramanlab.groups.io>;
许可证:
该项目是根据GPLv3许可证授权的。
注:
不包括cplex和gurobi。两种都是免费的 学术目的)。支持其接口为 由optlang提供。