fastsl-py算法是一种在基因组代谢模型中识别合成致死基因/反应集的有效算法。

fastsl的Python项目详细描述


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这是fastsl的python实现,它是 基因组规模代谢中合成致死基因/反应集的鉴定 模型。

此包基于 cobrapy并提供了一个简单的 命令行工具。

有关文档,请访问:http://fastsl py.readthedocs.io

基本要求:

- Python 3.6 for Gurobi 8
- Python 3.5 for IBM CPLEX and Gurobi 7

安装:

使用pip从pypi安装(建议在虚拟环境中安装):

pip install fastsl

贡献:

  • 问题跟踪器:<;https://github.com/ramanlab/fastsl py/issues>;

支持:

如果你有问题,请告诉我们。 联系我们:<;fast-sl@ramanlab.groups.io>;

许可证:

该项目是根据GPLv3许可证授权的。

注:

不包括cplex和gurobi。两种都是免费的 学术目的)。支持其接口为 由optlang提供。

欢迎加入QQ群-->: 979659372 Python中文网_新手群

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