elifetools 0.1.8

elife工具

在python中使用文章数据的工具

支持

• python 2.7版
• python>；=3.5

非python依赖项

• libxml2（ubuntu，arch）

为用户安装

通过pip安装：

$ pip install elifetools

您可能需要先手动安装libxml

$ sudo STATIC_DEPS=true pip install lxml==3.4.1

直接从git安装最新版本

$ pip install git+https://github.com/elifesciences/elife-tools.git@master

或者可以将其添加到项目的requirements.txt文件中

git+https://github.com/elifesciences/elife-tools.git@master

为开发人员安装

克隆Git回购协议

制作一个virtualenv（可选）

然后

$ python setup.py install

示例用法

>>>fromelifetoolsimportparseJATSasparser>>>soup=parser.parse_document('sample-xml/elife-kitchen-sink.xml')>>>printparser.doi(soup)

更多的代码示例可以在tests/basic\u usage\u test.py中找到

这些代码示例可以使用以下命令运行：

$ cd elifetools/
$ python -m unittest discover -s tests  -p *_test.py

以及XML输出：

$ cd elifetools/
$ python -m xmlrunner discover -s tests -p *_test.py

测试

您可以使用以下命令从基本文件夹运行全自动测试套件：

$ python -m unittest discover elifetools/tests

或者您可以运行覆盖率为：

$ coverage run -m unittest discover elifetools/tests

然后查看覆盖率报告：

$ coverage report -m

许可证

The MIT License