EEGIO:emepython和MNEBIDS兼容的eeg数据io包。
eegio的Python项目详细描述
脑电图IO
一个易于使用的API接口与EDF格式的EEG数据,或BIDS-EEG布局中的FIF格式。 此模块存储用于人类患者的脑电数据IO的代码,以及将临床中心数据(即时间序列EEG、临床元数据)转换为开发人员友好的数据集的流水线代码,该数据集也是可逆的和调试友好的。在
托多
- []添加对通过神经影像处理数据添加结构上下文的支持(例如FreeSurfer)
安装指南
EEGio旨在成为一个轻量级的包装器,可以方便地用EEG数据分析大量患者。eegio依靠以下库工作:
numpy
scipy
scikit-learn
pandas
mne
mne-bids
pybids
seaborn
matplotlib
pyedflib (deprecated)
xlrd (deprecated)
预期用户/用途
癫痫研究人员处理符合BIDS和MNE格式的EEG数据。任何有人类病人脑电图数据的人。
有关如何格式化此文件的信息,请参阅示例和文档。在
- https://github.com/bids-standard/bids-specification/blob/master/src/04-modality-specific-files/04-intracranial-electroencephalography.md
- https://github.com/bids-standard/bids-starter-kit/wiki/The-BIDS-folder-hierarchy
设置BIDS目录并从EDF/FiF读取EEG数据
这些只是用于加载EDF/FiF数据的MNE/pyedflib读取的轻量级包装 很容易,所以原始的EEG-ts很容易以Python友好的格式访问。我们提供 一个基于跨国公司投标案例的例子。 见example。在
有关详细信息,请参阅教程和文档。在
贡献
我们欢迎任何人的贡献。请查看我们的contribution guidelines。我们的issues页面是一个提供建议的好地方! 如果您有一个没有列出的改进的想法,请先make an issue以便与开发人员讨论。 有关设置测试的信息,请参见testing guide。在
许可证
此项目包含在GNU GPL许可证下。在
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