面向机器学习的蛋白质特征提取软件包

discere的Python项目详细描述


Build StatusLicense: MITcodecovGitHub versionGitHub issues


面向机器学习的蛋白质特征提取


从蛋白质序列中提取特征用于机器学习/深度学习的Python代码

利用Biopython软件包进行蛋白质特征提取

**特点包括:

  1. AA计数
  2. 芳香性
  3. 二级结构
  4. 等电点
  5. 分子量
  6. 不稳定性指数

执行代码所需的包(不是内置的)。。。 -熊猫 -泡菜 -生物赛顿 -子流程

安装

对于windows

pip install discere

对于linux

^{pr2}$

使用

importdiscere.discereasdidi.extract_feature('./Documents/positive_training.fasta','./Documents/negative_training.fasta','./Documents')

输出

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