数字表达数据的分层非参数贝叶斯聚类
DGEclust的Python项目详细描述
dgeclust是一个对数字表达式数据进行聚类和差分表达式分析的程序 由下一代测序分析产生，如rna序列、cage等。它接受一个表作为输入 它估计数据支持的集群的数量和参数。在后期， 它们可用于识别差异表达的基因，以及对 原始数据矩阵。在内部，dgeclust使用hierarchical dirichlet进程混合模型进行建模 过分散的计数数据，结合一个blocked gibbs sampler实现有效的贝叶斯学习。
这个程序是[计算基因组学组]（http://bioinformatics.bris.ac.uk/）软件集合的一部分。 在布里斯托尔大学，它正在不断发展。您可以在 本软件在以下论文中使用的统计方法：
- http://www.genomebiology.com/2015/16/1/39（Vavoulis等人，基因组生物学16:39，2015）
- http://arxiv.org/abs/1301.4144（Vavoulis&Gough，^{EM1}$J计算机科学系统生物学
7:001-009，^{STR 1}$2013）
有关详细信息（包括错误报告），请发送电子邮件至<；Dimitris.Vavoulis@ndcls.ox.ac.uk>；或<；Julian.Gough@bristol.ac.uk>；
享受吧！
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