从dcm2niix将nifti文件重新组织到脑成像数据结构中
dcm2bids的Python项目详细描述
DCM2bids
dcm2bids将nifti文件从dcm2niix重新组织到Brain Imaging Data Structure（bids）。
在使用本软件之前，请了解有关出价的更多信息：
- 阅读出价specifications和paper
- 一些数据集examples
按照guide
安装
pip install dcm2bids
或
pip install --user dcm2bids
依赖关系
- dcm2niix将dicom转换为nifti。您需要安装它
升级
pip install --upgrade dcm2bids
tl；dr
在出价中获取数据的步骤：
cd <YOUR_FUTURE_BIDS_FOLDER>dcm2bids_scaffolddcm2bids_helper -d <FOLDER_WITH_DICOMS_OF_A_TYPICAL_SESSION>- 借助
tmp_dcm2bids/helper的内容构建配置文件
dcm2bids -d DICOM_DIR -p PARTICIPANT_ID -c CONFIG_FILE对于您研究的每个参与者
dcm2bids在<YOUR_FUTURE_BIDS_FOLDER>/tmp_dcm2bids/log内创建日志文件
投标确认人
运行bids-validator检查目录。别忘了在bids目录的根目录中创建一个.bidsignore文件，其中包含tmp_dcm2bids/*。
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欢迎加入QQ群-->： 979659372
