基因组学数据库。

dbgen的Python项目详细描述


Travis (.org)Codecov

PyPI licensePyPI

DBGen是一个提供通用数据库的python包 支持基因组数据分析研究。在

当前的实现基于mongoDB。在

快速入门

您可以从安装DBGen及其所有依赖项 PyPI

$ pip install -r requirements.txt dbgen

来源

源代码和最小的工作示例可以在 GitHub。在

文件

文件 latest stable version 在ReadTheDocs上提供。在

运行测试

您可以使用python从命令行运行所有单元测试:

^{pr2}$

或覆盖范围:

$ coverage run -m unittest discover

贡献

请阅读 contributing section 有关我们行为准则的详细信息,以及向我们提交拉取请求的过程。在

作者

Pietro Barbiero,计算科学家。在

许可证

版权所有2020 Pietro Barbiero。在

根据Apache许可证2.0版(“许可证”)授权;您可以 除非符合许可证,否则不要使用此文件。你可以得到 许可证副本位于:http://www.apache.org/licenses/LICENSE-2.0。在

除非适用法律要求或书面同意 根据许可证分发的是“按原样”分发的, 没有任何明示或暗示的保证或条件。在

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