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CovFuzze的Python项目详细描述
#covfuzze plot
一个python脚本，用从多个重复中计算出的标准差来绘制基因覆盖率和ip峰。
用法：gene_peak_plot.py[-h][-g gene][-o out]--bams bams[bams…]--bed
bed[-gtf gtf][-p peaks]-l labels[labels…]
[-n nsubplots][-normalize]
使用0.18.1
-seaborn测试，使用0.7.1
-matplotlib测试，使用2.0.2
-pybedtools测试，使用0.7.10测试-需要路径中可用的bedtools
--感兴趣区域的bed bed bed文件
-l labels[labels…]，--labels labels[labels…]
与BAMS关联的标签-如果复制，请使用相同的
labels
````
-帮助显示该帮助信息并退出
-G基因，即基因基因名称（默认＝GEDEDOE）
基因GTF GTF GTF文件，用于绘制外显子为阴影区：BR/> -P峰，峰峰
床档，峰
-N N次图，-NS-图NSUBITS
子批次-BAM将根据给定的顺序（默认值=1）平均分割
--按基因长度/总覆盖率（默认值=
false）规范化
```
对齐/sample_1_input.sample.star.bam对齐/sample_1_ip.sample.star.bam
对齐/sample_2_input.sample.star.bam对齐/sample_2_ip.sample.star.bam
对齐/sample_3_input.sample.star.bam对齐/sample_3_ip.sample.star.bam
--床${gene}u exons.bed
-l sample_input sample_ip sample输入样本ip样本输入样本ip
--gene${gene}-n 1--normalize
````
一个python脚本，用从多个重复中计算出的标准差来绘制基因覆盖率和ip峰。
用法：gene_peak_plot.py[-h][-g gene][-o out]--bams bams[bams…]--bed
bed[-gtf gtf][-p peaks]-l labels[labels…]
[-n nsubplots][-normalize]
使用0.18.1
-seaborn测试，使用0.7.1
-matplotlib测试，使用2.0.2
-pybedtools测试，使用0.7.10测试-需要路径中可用的bedtools
--感兴趣区域的bed bed bed文件
-l labels[labels…]，--labels labels[labels…]
与BAMS关联的标签-如果复制，请使用相同的
labels
````
-帮助显示该帮助信息并退出
-G基因，即基因基因名称（默认＝GEDEDOE）
基因GTF GTF GTF文件，用于绘制外显子为阴影区：BR/> -P峰，峰峰
床档，峰
-N N次图，-NS-图NSUBITS
子批次-BAM将根据给定的顺序（默认值=1）平均分割
--按基因长度/总覆盖率（默认值=
false）规范化
```
对齐/sample_1_input.sample.star.bam对齐/sample_1_ip.sample.star.bam
对齐/sample_2_input.sample.star.bam对齐/sample_2_ip.sample.star.bam
对齐/sample_3_input.sample.star.bam对齐/sample_3_ip.sample.star.bam
--床${gene}u exons.bed
-l sample_input sample_ip sample输入样本ip样本输入样本ip
--gene${gene}-n 1--normalize
````
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