在FHIR集成管道中使用的Python脚本来清理不同外部源的输入数据。

cleaning-scripts的Python项目详细描述


清理脚本

ArkhnGitHub license

这是一个Python脚本存储库,在FHIR集成管道中用于清理不同外部源的输入数据。在

脚本

脚本有4种类型:

  • scripts/custom用于执行特定任务的用户定义脚本,例如清除患者电话号码
  • scripts/utils基本脚本(如大写、测试是否为空等)
  • scripts/logic(Beta)脚本,其操作类似于逻辑语句,并以其他脚本作为参数

scripts/custom可以由用户扩展,可以通过完成新脚本,也可以在没有人满足其需求时添加新脚本。这是使用API完成的。在

美国石油学会

该API既可以用作小型web服务,也可以通过Pyrog接口直接访问。在

手动安装

要设置API:

set GITHUB_TOKEN=<your_github_token>
flask run

检查`http://localhost:5000

Docker

^{pr2}$

或者

docker build -t cleaning-scripts:latest .
docker run -p 5000:5000 --env-file=app/.env cleaning-scripts

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