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CGRtools的Python项目详细描述
cgrtools
基于凝聚反应图(CGR)方法的反应处理工具。
- 基本操作:
- 读/写/转换格式mdl.rdf和.sdf,smiles,.mrv
- 标准化反应和有效结构检查。
- 生成CGR。
- 执行子图搜索。
- 建立/纠正分子和反应。
- 产生基于模板的反应。
安装
基于Linux Debian的
安装python3.7、virtualenv和git
^{tt1}$
创建新环境并激活它。
^{tt2}$
mac
使用[brew](<;https://brew.sh>;)安装python3.7和git
^{tt3}$
安装Virtualenv。
^{tt4}$
创建新环境并激活它。
^{tt2}$
窗口
使用[巧克力]安装python3.7和git(<;https://chocolatey.org/>;)
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安装Virtualenv。
^{tt4}$
创建新环境并激活它。
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一般零件
stable版本将通过pypi提供
^{tt9}$
为未经良好测试的功能安装cgrtools库开发版本
^{tt10}$
Jupyter集成:
^{tt11}$
将教程文件下载到同一目录
从jupyter浏览器的tutorial目录中打开.ipynb文件
如果您还有问题,请在github中打开问题。
版权所有
2014-2019年Ramil Nugmanov<;stsouko@live.ru>;主要开发商 2014-2019 Timur Madzhidov<;tmadzhidov@gmail.com>;原子排序算法和API讨论 2014-2019年Alexandre Varnek<;varnek@unistra.fr>;CGR方法的基本思想
贡献者
- 蒂穆尔吉马迪耶夫<;timur.gimadiev@gmail.com>;
- 拉维尔·穆哈梅特加列夫<;sonic-mc@mail.ru>;
- Tagir Akhmetshin tagirshin@gmail.com>;
- Adelia Fatykhova adelik21979@gmail.com>;
- 迪纳尔·巴蒂尔申batyrshin-dinar@mail.ru>;