python的自定义过滤构造函数
cechmate的Python项目详细描述
此库为适合与Phat一起使用的自定义筛选提供易于使用的构造函数。
phat目前为边界矩阵的持久性约简算法提供了一个干净的接口。
此工具有助于缩小数据和边界矩阵之间的差距。
目前,我们支持α、rips和cech过滤液的构建,并为phat提供一个简单的界面。
如果您有一个您想要实现的特定过滤,请随时联系我们,我们可以帮助您实现和集成,以便其他人可以使用它。
设置
我们在此库中使用以下依赖项
- 努比
- scipy
- matplotlib
- phat
最新版本的cechmate可以在pypi上找到,并与pip一起安装:
pip install cechmate
贡献
我们欢迎各种形状和大小的捐款。有很多潜在的项目机会,所以如果你想帮忙的话,请联系我们。从你最喜欢的距离的实现,笔记本,例子,和文件都是同样有价值的,所以请不要觉得你不能贡献。
若要参与,请分叉项目进行更改并提交拉取请求。我们将尽最大努力解决与您有关的任何问题,并将您的代码合并到主分支中。
文档
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