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caravagene的Python项目详细描述
…原始：：html
<；p align="center">；
<；img alt="caravagene logo"title="lala logo" src="https://raw.githubusercontent.com/edinburgh-genome-foundry/caravagene/master/logo.png"width="500">；
<；br/><；br/>>；
<；p>；
图片：https://travis-ci.org/edinburgh-genome-foundry/caravagene.svg？branch=master
：目标：https://travis ci.org/edinburgh genome foundry/lala
：alt:travis ci构建状态
…图片：：https://coveralls.io/repos/github/edinburgh-genome-foundry/caravagene/badge.svg？branch=master
：目标：https://coveralls.io/github/edinburgh-genome-foundry/caravagene？branch=master
caravagene（完整文档`此处<；https://edinburgh genome foundry.github.io/caravagene/>；``uu）是一个python库，用于从一个部分列表绘制dna结构的模式：
。代码：：python
部分（'insulator'，label='i1'）
]）
构造.到图像（'construct.jpeg'）
…原始：html
<；p align="center">；
<；img src="https://raw.githubusercontent.com/edinburgh-genome-foundry/caravagene/master/examples/construct.jpeg"width="600">；
<；/p>；
https://raw.githubusercontent.com/edinburgh genome foundry/caravagene/master/examples/multiconstruct.pdf>；`
显示多个结构：
…代码：：python
部分（'rc1'，category='recombose-recognition-sequence'），
部分（'my promotor'，category='promotor'），
部分（'rna稳定性'，category='rna-stability-sequence'），
部分（'<；i>；acs<；/i>；'，category='cds'），
部件（'polya'，category='terminator'），
部件（'i1'，category='绝缘体'），
构造（name="asm2"，部件=[
部件（'my promotor'，category='promotor'），
部分（'gene with a very long name'，category='cds'），
部分（'polya'，category='terminator'），
部分（'i1'，category='insulator'）
]
]
My_constructs.to_pdf（'multiconstruct.pdf'）
……原始：：html
<；p align="center">；
<；img src="https://raw.githubusercontent.com/edinburgh-genome-foundry/caravagene/master/examples/multiconstruct_screen_capture.png"width="800">；
<；/p>；
也可以扩展caravagene以支持其他类别/符号，如下所示：
…代码：：python
from caravagene import symbol_files
symbol_files['my-new-category']="path/to/some/symbol.svg'
>最后，这里是一个使用excel电子表格的示例：
**电子表格：**
。原始：html
<；p align="center">；
<；img src="https://raw.githubusercontent.com/edinburgh-genome-foundry/caravagene/master/examples/from_spreadsheet_sample.png"width="600">；
<；/p>；
**Python代码：**
代码：：python
from caravagene import constructlist
my_constructs=constructlist（"my_spreadsheet.xlsx"）
my_constructs.to_pdf（'my_schemas.pdf'）
或**命令行（一次性使用）：**
代码：：外壳y_spreadsheet.xlsx my_schemas.pdf
或**命令行（当电子表格在磁盘上更改时重新呈现）：**
…代码：：shell
caravagene my_spreadsheet.xlsx my_schemas.pdf--查看
**输出：**
…原始：html
<；p align="center">；
<；img src="https://raw.githubusercontent.com/edinburgh-genome-foundry/caravagene/master/examples/from_spreadsheet_capture.png"width="700">；
<；/p>；
安装
----
安装它。代码：：shell
（sudo）apt get install wkhtmltopf
代码：：shell
sudo pip install caravagene
代码：：shell
sudo python setup.py install
license
--
欢迎大家参与！< BR>
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<；img alt="caravagene logo"title="lala logo" src="https://raw.githubusercontent.com/edinburgh-genome-foundry/caravagene/master/logo.png"width="500">；
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图片：https://travis-ci.org/edinburgh-genome-foundry/caravagene.svg？branch=master
：目标：https://travis ci.org/edinburgh genome foundry/lala
：alt:travis ci构建状态
…图片：：https://coveralls.io/repos/github/edinburgh-genome-foundry/caravagene/badge.svg？branch=master
：目标：https://coveralls.io/github/edinburgh-genome-foundry/caravagene？branch=master
caravagene（完整文档`此处<；https://edinburgh genome foundry.github.io/caravagene/>；``uu）是一个python库，用于从一个部分列表绘制dna结构的模式：
。代码：：python
部分（'insulator'，label='i1'）
]）
构造.到图像（'construct.jpeg'）
…原始：html
<；p align="center">；
<；img src="https://raw.githubusercontent.com/edinburgh-genome-foundry/caravagene/master/examples/construct.jpeg"width="600">；
<；/p>；
https://raw.githubusercontent.com/edinburgh genome foundry/caravagene/master/examples/multiconstruct.pdf>；`
显示多个结构：
…代码：：python
部分（'rc1'，category='recombose-recognition-sequence'），
部分（'my promotor'，category='promotor'），
部分（'rna稳定性'，category='rna-stability-sequence'），
部分（'<；i>；acs<；/i>；'，category='cds'），
部件（'polya'，category='terminator'），
部件（'i1'，category='绝缘体'），
构造（name="asm2"，部件=[
部件（'my promotor'，category='promotor'），
部分（'gene with a very long name'，category='cds'），
部分（'polya'，category='terminator'），
部分（'i1'，category='insulator'）
]
]
My_constructs.to_pdf（'multiconstruct.pdf'）
……原始：：html
<；p align="center">；
<；img src="https://raw.githubusercontent.com/edinburgh-genome-foundry/caravagene/master/examples/multiconstruct_screen_capture.png"width="800">；
<；/p>；
也可以扩展caravagene以支持其他类别/符号，如下所示：
…代码：：python
from caravagene import symbol_files
symbol_files['my-new-category']="path/to/some/symbol.svg'
>最后，这里是一个使用excel电子表格的示例：
**电子表格：**
。原始：html
<；p align="center">；
<；img src="https://raw.githubusercontent.com/edinburgh-genome-foundry/caravagene/master/examples/from_spreadsheet_sample.png"width="600">；
<；/p>；
**Python代码：**
代码：：python
from caravagene import constructlist
my_constructs=constructlist（"my_spreadsheet.xlsx"）
my_constructs.to_pdf（'my_schemas.pdf'）
或**命令行（一次性使用）：**
代码：：外壳y_spreadsheet.xlsx my_schemas.pdf
或**命令行（当电子表格在磁盘上更改时重新呈现）：**
…代码：：shell
caravagene my_spreadsheet.xlsx my_schemas.pdf--查看
**输出：**
…原始：html
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<；img src="https://raw.githubusercontent.com/edinburgh-genome-foundry/caravagene/master/examples/from_spreadsheet_capture.png"width="700">；
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安装
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安装它。代码：：shell
（sudo）apt get install wkhtmltopf
代码：：shell
sudo pip install caravagene
代码：：shell
sudo python setup.py install
license
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欢迎大家参与！< BR>
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