集成连续生物制造过程停留时间分布(RTD)建模库。
bio-rtd的Python项目详细描述
生物电阻数据库
bio rtd库是一个用于建模的python库 停留时间分布(RTD) 集成的连续生物制造过程。在
版本
当前版本:0.7.1
要求
Python 3.7+
核心依赖项:
numpy
scipy
示例中用于可视化表示的软件包:
^{pr2}$用于从Excel导入数据的包示例:
pandas
设置
使用包管理器:
pip install bio_rtd
要运行示例,请下载或克隆github repo:
git clone https://github.com/open-biotech/bio-rtd.git
并将本地目标(/path_to/bio-rtd
)设置为工作目录
或者将其添加到python路径中。在
入门
示例可以作为脚本运行:
python examples/models/single_pcc.py
以_gui.py
结尾的模型示例
可以通过bokeh serve
命令运行:
bokeh serve examples/models/integrated_mab_gui.py
或者
python bokeh serve examples/models/integrated_mab_gui.py
有关详细信息,请参阅Documentation。在
文件
可以在https://open-biotech.github.io/bio-rtd-docs/或通过构建本地版本来访问文档。在
要生成文档的本地版本,请安装以下软件包:
pip install sphinx sphinx_autodoc_typehints sphinx_rtd_theme
运行命令:
make html
并使用web浏览器打开docs/build/html/index.html
。在
元信息
根据麻省理工学院的许可证分发。有关详细信息,请参见LICENSE
。在
对于技术问题,错误报告和功能请求使用 issue tracker。在
如果要对代码作出贡献,请参见 Developers guide。在
如果您在项目中使用库,请让 us know。 这样我们就知道有多少人感兴趣,使用范围是什么, 这些信息会影响项目的未来发展。在
维也纳自然资源与生命科学大学
引用库
如果你用这个软件包做科学出版物, 请添加以下参考:
- Senčar,J.,(2020)GitHub存储库, https://github.com/open-biotech/bio-rtd。在
致谢
这项工作得到以下方面的支持:
- 联邦数字和 经济事务部(bmwd),联邦交通部, 创新与技术(bmvit), Styrian商业促进机构SFG, 泰罗尔广场, 下奥地利政府, 以及维也纳市技术局 通过彗星基金项目管理 奥地利研究促进机构
- Baxalta Innovations GmbH(现为武田的一部分)
- 比尔芬格工业技术公司
- 项目
标签: