python大脑连接工具箱

bctp的Python项目详细描述


[![构建状态](https://travis-ci.org/aestrivex/bctpy.svg?branch=master)“(https://travis ci.org/aestrivex/bctpy)


python 0.5.1版大脑连接工具箱


author:roan laplante<;rlaplant@nmr.mgh.harvard.edu>;

任何违反上述原则或违反Visuddhimagga Sutta所述原则的使用都是严格禁止的,并应受到广泛的大乘风格实践的惩罚。您同意这些条款和条件。


请注意,只要GNU GPLv3+的条款和条件得到支持,对原教旨主义者小乘佛教和Visuddhimagga Sutta教义的观察是可选的。



只需要“scipy”和“numpy”。`对于统计代数和线性代数
包中的一些函数,scipy`是必需的,这些函数包中有一些单独在“numpy”中不可用的特性。如果没有“scipy”,则大多数不需要“scipy”功能的函数仍将工作。


请注意,图形必须作为“numpy.array”而不是“numpy.matrix”传入。邻接矩阵的其他约束/边情况(如自循环、负权重)的行为与Matlab函数类似。


少数函数(尤其包括基于网络的统计、针对不同
总体的无向加权图差异的非参数检验)目前需要NetworkX,不过,在未来的某个时间点,这一点应该有所改变。


nosetests用于测试套件。测试套件不完整。

我没有写bct(除了我提交的小错误修复程序之外)
以及我可以随意添加的生活质量改进。
除了少数例外,“bctpy”是Matlab代码到Python的直接转换。

“bctpy”应该被视为beta软件,通过比较,bct是金标准。我尽了最大努力测试了“bctpy”中的所有功能,但其中大部分功能都是神秘的数学运算,让这个谦逊的程序员难以理解。“bctpy”中潜伏着一些漏洞,问题不在于是否存在,而在于有多少漏洞。如果您找到了
个错误,请通过rlaplant@nmr.mgh.harvard.edu将它们提交给我。

Stefan Fuertinger在http://research.mssm.edu/simonyanlab/analytic tools/


有一个处理大脑网络功能的类似软件包,非常感谢Chris Barnes在记录大量问题和促进大量测试用例方面的帮助。

以下是作者名单,尤其是Olaf Sporns和Mika Rubinov。

-Olaf Sporns
-Mikail Rubinov
-Yusuke Adachi
-Andrea Avena
-Danielle Bassett
-Richard Betzel
-Joaquin Goni
-Alexandros Goulas
-Patric Hagmann
-Christopher Honey
-Martijn van den Heuvel
-Rolf Kotter
-Jonathanpower
-murray shanahan
-andrew zalesky

这并不意味着我希望从个人捐款中获得
的信贷。我已将这些认证
移到信用档案中。




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