“磁共振扩散数据中噪声分布的自动表征”的实现。
autodmri的Python项目详细描述
磁共振扩散数据中噪声分布的自动表征
示例和文档
最新版本可以与一起安装
pip install autodmri
您可以在here上找到一个快速示例和数据集，并在http://autodmri.rtfd.io/找到完整的文档。在
使用Docker
如果你有docker，你不需要安装任何其他东西，可以使用Dockerfile来获取所有东西。 然后，您可以挂载您的数据文件夹来运行脚本，并将结果放入相同的文件夹中，如下所示。在
^{pr2}$只需确保调整数据的路径和文件名，或者根据需要添加更多选项。在
手稿和参考文献
您可以阅读医学图像分析中的journal version，数据集在这里https://zenodo.org/record/2483105。在
手稿的会议版（如MICCAI 2018年出版）免费提供here 从publisher开始。在
这是期刊版的bibtex条目
@article{St-jean2020_media,
author = {St-Jean, Samuel and {De Luca}, Alberto and Tax, Chantal M.W. and Viergever, Max A. and Leemans, Alexander},
doi = {10.1016/j.media.2020.101758},
eprint = {1906.12121},
issn = {13618415},
journal = {Medical Image Analysis},
month = {jun},
pages = {101758},
title = {{Automated characterization of noise distributions in diffusion MRI data}},
url = {https://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/S1361841520301225},
year = {2020}
}
还有米猜的会议稿
@InProceedings{St-jean2018_miccai,
author="St-Jean, Samuel
and De Luca, Alberto
and Viergever, Max A.
and Leemans, Alexander",
editor="Frangi, Alejandro F.
and Schnabel, Julia A.
and Davatzikos, Christos
and Alberola-L{\'o}pez, Carlos
and Fichtinger, Gabor",
title="Automatic, Fast and Robust Characterization of Noise Distributions for Diffusion MRI",
booktitle="Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention -- MICCAI 2018",
year="2018",
publisher="Springer International Publishing",
address="Cham",
pages="304--312",
isbn="978-3-030-00928-1"
}
引用代码本身
代码也在zenodo上自动存档，以供那些想要引用特定版本的用户使用
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