对列使用groupby后重复值的实例计数我正在处理的数据集如下所示: col1 person1 gene1 person1 gene1 person1 gene2 person1 gene3 person1 gene4 perso ...2024-09-28 已阅读: n次
匹配除某些单词外的所有字符在过去的几天里,我一直在学习Regex(在python中实现它),但还没有找到解决这个问题的方法。在 我有以下格式的文本: FOO1 = BAR2 AND Var1 Gene3 = Gene4 > ...2024-09-28 已阅读: n次
读取文件并输出包含主fi子集的新文件 我有一个包含数据行的文本文件。我想使用python创建新的更小的文本文件,每个文件都包含这个主文本文件的指定子集。每个新文件都应该以第3列中的一个字符串命名,该文件应该包含第3列中包含该字符串的所有 ...2024-09-28 已阅读: n次
Excel和scipy累积二项分布p值之间的差异?我有这个表格(NumSucc=成功次数,numtrials=试验次数,Prob是成功的概率): Gene NumSucc NumTrials Prob Gene1 16 26 ...2024-09-28 已阅读: n次
根据第2、3、4列的数值总和获取唯一行我制作了一个字典,用R进行分析,这个字典需要有唯一的标签。你知道吗 我的数据是这样的 Labels t1 t2 t3 gene1 0.000000E+00 0.000000E+00 ...2024-09-28 已阅读: n次
Pandas:不同大小数据帧之间的复杂映射我需要映射两个完全不同的数据帧(感谢生物学)。所有关于pandas的教程都是简单得多的转换,如果没有4个嵌套循环,我就无法解决这个问题(真正的新手)。真的很好奇一个Python的方式来解决这个问题,而 ...2024-09-28 已阅读: n次
使用行值决定要在数据帧中相乘的列我有一个数据帧df1,它有0和1。 我想用它来决定在另一个数据帧df2中添加什么值,并打印所有疾病的最高值。你知道吗 df1型 Gene1 Gene2 Gene3 Gen ...2024-09-28 已阅读: n次
Python:将列表列表转换为分层字典我有一些基因测序数据如下: data = [{'sequence': 'gene1__gene2__gene3', 'occurrence': 10}, {'sequence': 'g ...2024-09-28 已阅读: n次
如何基于列将数据帧拆分为多个数据帧我有以下数据帧: import pandas as pd df = pd.DataFrame( { "Name" : ["gene1","gene2","gene3","gene4"] , ...2024-09-28 已阅读: n次
根据列中设置的截止值提取特定行我有一个制表符分隔的.txt文件,如下所示。在 Gene_name A B C D E F Gene1 1 0 5 2 0 0 Gene2 ...2024-09-28 已阅读: n次
写函数:plt的绘图条,可选参数打印标题()def plot_coexpression(new, gene1='', gene2='', gene3='', gene4='', gene5='', gene6=''): X, Y = z ...2024-09-28 已阅读: n次
从具有相同值的多行获取相关性(Python)所以我正在编写一个脚本来比较数据,我需要关联收集到的数据。数据框由一列基因组成,这些基因与其他基因进行比较以得到重复的基因。我需要有相同重复基因的基因之间的关联。你知道吗 示例数据: Index G ...2024-09-28 已阅读: n次