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关于actg 相关联的Python项目和问题：

实际上我有fasta的文件，比如： >seq1:QXQXQWQ:XQWQ ACTG >seq3:WCCWHWJ:WGH ATGC >seq7:GCGC:G ATGACA 我想去掉第 ...

2024-09-30 已阅读: n次

我有一个非常长的字符串，字母表限制为4。我能用不同的方式存储这个字符串吗？这样它占用的空间就更少了，因为它的字母表很小，而不是普通的字符串？在我的代码中，我从不编辑这个字符串，只访问索引中的字符。如果 ...

2024-09-30 已阅读: n次

这是我一直在写的代码。我试着用结构索引一个给定的DNA链的方法，但没有用。这段代码的某个地方有个错误，但我不确定我忘了包括什么。如果你能告诉我为什么这个程序不起作用，那就太好了： class dnaS ...

2024-09-30 已阅读: n次

我有一个字典，我想洗牌的价值观，而不是键。例如： {"a": "ACAT", "b": "ACTG", "c": "ACCC"} 洗牌之后： {"a": "ACAT", "b": "ACTG", " ...

2024-09-30 已阅读: n次

所以我尝试创建一个regex子句，它可以检测'ACTG'字符的任何组合，并将其视为有效的。而其他任何东西——包括'ACTG'和一些其他字符的组合都是无效的。在最后，我将把它从while循环中取出，这 ...

2024-09-30 已阅读: n次

我正在尝试用python编写一个代码，给定给定字母表中的正则表达式，它将提供所有可能的具有类似自由度的备选方案。例如，如果我的字母表是ACTG（DNA核苷酸），我的正则表达式是[AG]CG（一个包含 ...

2024-09-30 已阅读: n次

有两个问题我想问任何熟悉纽比的人。我已经看到了非常相似的问题（和答案），但没有一个使用numpy，我想使用它，因为它提供了许多其他选项，我可能希望在未来的代码中使用。我尝试在python中使用“ra ...

2024-09-30 已阅读: n次

我正在尝试用卷积神经网络对DNA序列进行分类。DNA序列被转换成一个输入阵列，编码为一个热载体。例如，“ACTG”编码为[[1,0,0,0]，[0,1,0,0]，[0,0,0,1]，[0,0,1,0] ...

2024-09-30 已阅读: n次

我想对序列重新采样，如下所示： fastadict = {"seq1" : "ATGCAGTCACGT", "seq2" : "ATGTGTGTACG"} 我写了以下函数： ^{pr2}$ 对于示例 ...

2024-09-30 已阅读: n次

大家好，我是编程新手，我有一个问题：我想修改列表中的字符串，更准确地说，如果子字符串出现在另一个字符串列表中，则删除该子字符串。我尝试过这个解决方案，但不起作用 res=[] a=['ACTGACT ...

2024-09-30 已阅读: n次

我有两组字符串-每组大约5000个字符串-（更具体地说，序列只包含ACTG），它们根据一些其他数据分为两组。每根弦的长度都是相等的，效率并不重要。给定一个特定的序列，我希望能够确定该字符串属于哪一类 ...

2024-09-30 已阅读: n次

我对以下代码的输出是只保存结果的最后一行，而不是将每一行值放入csv文件中。我对python的知识有限。我认为我的循环部分是不正确的。有人能帮我吗？你知道吗代码 import numpy as np ...

2024-09-30 已阅读: n次