从Python中运行命令行程序我试图在python代码中运行一个blat搜索。现在写的是。。。在 os.system('blat database.fa fastafile pslfile') 当我运行代码时,我为“fastaf ...2024-09-30 已阅读: n次
使用Biopython在NCBI上运行一个BLAT搜索我想用不同的序列运行几个BLAT查询,然后对结果执行多序列对齐。在 如何使用Python运行这些BLAT查询?在 我知道有一种方法可以使用BLAST,但我不确定BLAT。在 ...2024-09-30 已阅读: n次
在python-smtp-send\u-messag中嵌入子地址我从一个应用程序发送电子邮件,最近我从使用blat切换到使用原生python。为了解决反弹问题,我使用了在Blat中工作的子地址,但是我还没有让它在Python中工作。你知道吗 使用子地址或加地址,收 ...2024-09-30 已阅读: n次
Python子进程变量类型?我正在编写一个python代码,它使用一些只能从Unix终端访问的程序(windows7操作系统,使用putty终端)我已经看过无数篇文章,我知道有人问过类似的问题,但没有什么对我有用。在 这是密码 ...2024-09-30 已阅读: n次
使用dataframe.loc从一个数据帧到另一个数据帧调用信息的更有效方法我想知道你能不能提出一个更有效的方法 我有两个数据帧,如下所示: 1) 一个数据帧,包含各种“站”的位置: StationNames Lat Long 0 St1 ...2024-09-30 已阅读: n次
从PyCharm启动的Python脚本的os.environ['PATH']与我的sh不同我的路径中有一个名为blat的可执行文件,这意味着它可以在任何目录中打开的终端上工作。但是,当我运行subprocess.call(['blat', 'args', 'go', 'here'])时,我 ...2024-09-30 已阅读: n次
UCSC BLAT输出python有没有办法用Python从下面的BLAT结果中得到不匹配的位置号?在 00000001 taaaagatgaagtttctatcatccaaaaaatgggctacagaaacc 00000045 & ...2024-09-30 已阅读: n次
在预标记Python之间解析我尝试使用Python使用以下代码在PRE标记之间进行解析 s = br.open(base_url+str(string)) u = br.geturl() seq = br.open(u) bla ...2024-09-30 已阅读: n次