使用Counter()查找计数相等的所有元素。最常见我正在使用Counter()。最常见的集合。我的输入(例如counter\u list)有许多相等的元素,但是如果我使用counter(mylist),大多数\u都是公共的(1),而不是得到所有的结果 ...2024-06-03 已阅读: n次
向行添加值列表,然后将数据帧转换为长格式我有一个数据框,索引是基因组位置,值是p值: import pandas as pd from StringIO import StringIO from collections import def ...2024-06-03 已阅读: n次
如何使用pandas应用多个过滤器?如何使用pandas轻松应用100个值的多个过滤器? 有两列(列/列2)和500000行。 我的目标是:在sample.xlsx文件中找到一些值,如value-1、value-2等(应该包括所有这些值 ...2024-06-03 已阅读: n次
对列使用groupby后重复值的实例计数我正在处理的数据集如下所示: col1 person1 gene1 person1 gene1 person1 gene2 person1 gene3 person1 gene4 perso ...2024-06-03 已阅读: n次
在Python中,选择特定列只能形成一个数据帧使用python和pandas作为pd,我试图输出一个文件,该文件具有基于特定头的列子集。 下面是一个输入文件的示例 gene_input = pd.read_table(args.gene, sep ...2024-06-03 已阅读: n次
生物变异或真正受影响的基因。我是一名生物系的学生,在实验室里我们正在老鼠身上测试某种药物。在正常状态下,我们有多组生物复制的基因表达数据: gene replicate 1 ...2024-06-03 已阅读: n次
将列表按位置重新组合成分位数我有一个dict,其中每个键对应一个基因名,每个值对应一个列表。每个基因的列表长度不同,因为每个元素代表不同的核苷酸。每个位置的数字表示核苷酸的“分数” 因为每个基因的长度不同,我想通过将每个基因分成 ...2024-06-03 已阅读: n次
如何将色码添加到seaborn热图上的yticklabels?我有一个基因表达和细胞的矩阵,我想把它们显示为热图,这本身不是问题。然而,把所有的基因都显示为标签会太混乱,视觉上也不吸引人。因此,我将每个基因注释为属于一个特定的功能组,并希望将每个功能组表示为一种 ...2024-06-03 已阅读: n次
匹配除某些单词外的所有字符在过去的几天里,我一直在学习Regex(在python中实现它),但还没有找到解决这个问题的方法。在 我有以下格式的文本: FOO1 = BAR2 AND Var1 Gene3 = Gene4 > ...2024-06-03 已阅读: n次
读取文件并输出包含主fi子集的新文件 我有一个包含数据行的文本文件。我想使用python创建新的更小的文本文件,每个文件都包含这个主文本文件的指定子集。每个新文件都应该以第3列中的一个字符串命名,该文件应该包含第3列中包含该字符串的所有 ...2024-06-03 已阅读: n次
Excel和scipy累积二项分布p值之间的差异?我有这个表格(NumSucc=成功次数,numtrials=试验次数,Prob是成功的概率): Gene NumSucc NumTrials Prob Gene1 16 26 ...2024-06-03 已阅读: n次