如何在单个字典中对值进行成对比较?所以我有一个包含DNA序列的文件,我想对每个DNA序列进行两两比较 fast文件包含以下形式的内容: >dna1 TAGTACTGACCATGGCGTTTGTTG >dna2 ACCTTG ...2024-06-29 已阅读: n次
缩进中不一致地使用制表符和空格def contains_sequence(dna1, dna2): ''' (str, str) -> bool Return True if and only if DNA ...2024-06-29 已阅读: n次
是否使用matplotlib在colormap上未显示批注?我正在尝试为我的Needleman-Wunsch算法创建一个热图,但是,我似乎无法标记图形的各个单元格。该图形与我希望的非常接近,但是,我只是缺少单元格中的各个值。我遵循了matplotlib的文档和 ...2024-06-29 已阅读: n次
Biopython跑不了了所以我一直在试着和Biopython合作,我还是个新手。我的代码: fasta_string = open("C:\\Users\\saeed\\Desktop\\dna2.fasta").read( ...2024-06-29 已阅读: n次
从字符串列表的Python Hamming距离开始我是Python新手,我试图获得一对DNA序列之间的汉明距离。虽然我能做到这一点,但我真的不知道如何获得一对以上DNA序列的汉明距离列表。我想知道是否有人能在这方面指导我 dna1 = 'ACCTAT ...2024-06-29 已阅读: n次
带气泡的python递归所以,我遇到了一个问题,我收到两个字符串ACGT,一个只有字母,另一个包含字母和破折号“-”,两者长度相同。带破折号的字符串与没有破折号的字符串进行比较。一个接一个。对于每一对我都有一个评分系统。我为 ...2024-06-29 已阅读: n次
如何在定义的函数中使用map我们想使用使用定义函数(mutation_detector)的map函数,这个函数有两个参数:DNA(字符串)和mutated_DNA(字符串列表)。 因为某些原因它不起作用 DNA = "ATGCT ...2024-06-29 已阅读: n次
我在这个函数上做了什么错事?我不知道我做了什么-这是错的。 有人能帮我吗?在 def insert_sequence(dna1, dna2, number): '''(str, str, int) -> str ...2024-06-29 已阅读: n次
字符串串联/索引提供索引我正在尝试一些相对基本的字符串连接,但似乎找不到我收到的错误的来源。你知道吗 我的代码如下: def crossover(dna1, dna2): """ Slices both dn ...2024-06-29 已阅读: n次
我需要帮助完成python3中的一项作业。我需要创建一个函数来返回核苷酸的复合物函数返回如下消息: <function contains_sequence at 0x04020270> 但是,它返回正确的anwser,但该消息不能在shell中。 所以我的代码是: ...2024-06-29 已阅读: n次
python中从垂直到水平的输出?我试图创建两个随机dna序列列表,dna1和dna2。 下面的代码以垂直顺序返回dna1和dna2的随机序列。我想知道如何为每个dna结果创建一个水平格式的列表 import numpy as np ...2024-06-29 已阅读: n次
使用.read()添加额外的nonetype chinput = open("ex3.txt") DNA = input.read() DNA2 = "AAAACCCGGT" print "string=", DNA,"len=", len(DNA) ...2024-06-29 已阅读: n次