python搜索一组单词简单地说,我正在寻找一种使用正则表达式而不使用for循环在字符串中搜索一组单词的最快方法。i、 e.有没有办法做到这一点: text = 'asdfadfgargqerno_TP53_dfgnafoq ...2024-06-29 已阅读: n次
检查python列表中是否存在条目并添加元素我有两个python表单列表 list1 = [('TGFB1', 'TGFB1', 1), ('TGFB1', 'CRP', 0.4),('BRCA2', 'TP53', 0.3)] list2 = ...2024-06-29 已阅读: n次
保留在第一列中具有不同内容但在最后一列中具有相同内容的行我认为我的问题标题本身很有说明性。因此,我将在下面用一个原始数据帧和所需输出来表示一个实际示例 假设一个数据库有一个数据帧,如下所示: Gene VC TSB 1 ...2024-06-29 已阅读: n次
在python中解析文件中的列后获取唯一元素我正在使用python3.6。我有一个tsv文件,它由5列和>;100k行组成。我已经使用split函数通过分隔符来解析文件,我从中接收到带有索引的特定列。我正在撰写的专栏如下: CSF3R D ...2024-06-29 已阅读: n次
如何对python列表排序?我有以下格式的python嵌套列表。我需要根据第三个条目对列表进行排序。你知道吗 interactions = [[0 for x in xrange(3)] for x in xrange(3) ...2024-06-29 已阅读: n次
Python2.7:使用networkx绘图;节点属性为长字符串(仅通过将鼠标悬停在节点上可见)我想用networkx构建的网络,绘出一个基因相互作用的网络。假设我有10个节点,为了简单起见,9条边将1个节点连接到所有其他9个节点。你知道吗 我想保持节点标签作为基因可见(如EGFR,TP53等) ...2024-06-29 已阅读: n次
当在scrip中调用多个类型时,GridSearchCV挂起我一直在尝试在下面的脚本中使用sklearn的GridSearchCV多种类型(每次logistic回归一次,总计3次)。最后发生的是第一个logistic回归的第一个网格搜索完成了,当第二个网格搜索 ...2024-06-29 已阅读: n次
为数据集生成所有排列我有一个数据框,看起来像这样: df1 = pd.DataFrame({'Gene':['TP53', 'COX5', 'P16'], 'test':[1,3,0], 'Healthy':[0,0,2 ...2024-06-29 已阅读: n次
通过循环比较2个.csv文件我有15个.csv文件,格式如下: **File 1** MYC RASSF1 DAPK1 MDM2 TP53 E2F1 ... **File 2** K06227 C00187 GLI1 PTCH ...2024-06-29 已阅读: n次
TypeError:无法使用数据类型为[float64]的数组和类型为[bool]的标量执行“rand_u2;”我在python中运行了一个命令,如下所示: q1_fisher_r[(q1_fisher_r['TP53']==1) & q1_fisher_r[(q1_fisher_r['TumorST' ...2024-06-29 已阅读: n次
如何按列分组并输出由选项卡分隔的多个列我的目标是按“Patient”列分组,并在一行中输出每个患者=,然后按顺序从输入文件中输出多个列。理想情况下,我更希望在列标题中有一个计数器。下面是我的输入文件示例: Patient Test pa ...2024-06-29 已阅读: n次
Django应用程序视图如何从url中的Django数据库中获取条目并从数据库中获取视图的更多信息?我有一个django应用程序“test\u app”。test\u app页面-“domain/test\u app/”有一个指向app“Genes”中另一个页面的链接。这将带我进入“域/测试应用程序 ...2024-06-29 已阅读: n次