Python cgg_专题 - Python中文网

格式化地图和**kwargs，函数做什么？

示例 from urllib.request import urlopen def urltemplate(template): def opener(**kwargs): return ...

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我正在尝试为每组kmer创建一个新列表（在列表中）例如它应该返回： [['ATT', 'TTT', 'TTG', 'TGG', 'GGC'], ['TGC', 'GCC', 'CCT', 'CTT' ...

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我的数据框架由DNA序列组成，每列包含3个碱基，代表密码子。我的目标是在给定的条件下，将任何包含某个字符串的密码子更新为间隙。示例条件，如果我的密码子列表中的任何终止密码子出现在小于某个百分比的列中， ...

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我使用fasta文件格式，我只想从中提取序列，而不需要ids，然后分割序列，我编写以下代码 outfile=open('output.txt','r') for line in ope ...

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在数据帧中的给定数据中： pos M1 M2 Mk Mg1 F1_X F1_Y S1 Sk1 S2 Sj 1 G/G G/G G/G G/G ...

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我是一个生物信息学家，最近开始学习python，我对绘制一个图很感兴趣。在节点 set(['ACG', 'ATC', 'GAT', 'CGG', 'CGT', 'AAT', 'ATT', 'GGA' ...

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基是指A、T、G和C sample = [['CGG','ATT'],['GCGC','TAAA']] # Note on fragility of data: Each element can o ...

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我想为python脚本生成一个模式，其中指定的模式中必须存在任意数量的三个单词？你知道吗例如，给定一个序列： ATG GTC TGA CGA CGG CAG TAA AAA AAA GGG TGG ...

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在pandas数据帧中，我想使用applymap(somefunction)使用groupby（使用一些列索引值），我发现这很难实现。你知道吗 mcve_01.txt pos f1_i ...

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我正在尝试生成一个核苷酸基序来编码所选的氨基酸。例如-组氨酸是由CAT，CAC编码的。精氨酸是CGT、CGC、CGA、CGG、AGA和AGG。模式是：位于密码子-C或A中位于密码子-A或G中位 ...

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我在SIMBAD数据库上有大量的条件查询要做，例如： region(circle, 29.20 -0.214, 0.60d) & otypes in ('ClG','SCG','GrG','C ...

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sample = [['CGG','ATT'],['GCGC','TAAA']] #Frequencies of each base in the pair d1 = [[{'G': 0.66, ' ...

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