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关于seqb 相关联的Python项目和问题：

你会如何比较两份清单并“回顾”呢？你知道吗我正在比较两个列表的元素，如下所示： score = 0 for (x,y) in zip(seqA,seqB): if x == y: ...

2024-10-02 已阅读: n次

我已经写了一小段代码，可以检测两个字符串中同一位置是否有任何匹配的字符。如果有，则分数递增1，如果有2个或更多连续匹配字符，则分数递增3，如果没有匹配字符，则分数递减1。但问题是，当我尝试运行代码时 ...

2024-10-02 已阅读: n次

仅当COL1值是唯一的（只有一个与COL1值匹配）时，我才想将COL2值添加到列表中 List_lonely_sequences=[] 这是数据帧 COL1 COL2 SP1 SEQA SP1 ...

2024-10-02 已阅读: n次

我实际上有一个multifasta文件，比如： >seqA_0042_0035 AGGACCATGA >seqB_0035_0042 ATGGATGGAGGAGATG >seqC_0 ...

2024-10-02 已阅读: n次

你好，我需要合并两个数据帧第一个有两列 df1 Groups Names G1 SeqA G1 Seq1(+) G1 SeqC G1 Seq2(-) G1 Seq ...

2024-10-02 已阅读: n次

.rjust（）是如何工作的？为什么它会将字符相对于前一个字符放置，而不是相对于第一个字符放置（放置在屏幕最左边还是最左边）？我有一个例子： def pairwiseScore(seqA, seqB ...

2024-10-02 已阅读: n次

我有两个DNA序列（长序列），我想重复它们。我尝试了传统的for循环，但它需要线性时间，所以它有很大的复杂性，所以我想找到一种方法在这两个序列上循环，并比较没有线性时间的字符，有什么方法可以做到这一 ...

2024-10-02 已阅读: n次

我需要创建一个矩阵来计算LCS，然后打印出来。这是我的代码，但打印函数有问题（不知道如何将LCSmatrix值放入打印） def compute_LCS(seqA, seqB): for r ...

2024-10-02 已阅读: n次

我正试图创建一个python程序来读取fasta文件“顺序fa" 然后让程序根据名字对序列进行排序。在 Fasta文件如下所示： >seqA - human GCTGACGTGGTGAAGTCA ...

2024-10-02 已阅读: n次

基本上，我正在尝试解决LCS（最长公共子序列）问题。我需要构造一个表，可以用一个2D数组来表示。以下是C语言的部分代码： void get_lcs(int arraySize, char seqA[a ...

2024-10-02 已阅读: n次

我有一组520个流感序列，我已经做了多个序列比对，并计算了成对的身份矩阵。如果我想加入另一个序列，我必须重新排列所有的元素，并重新计算整个PWI矩阵。有没有什么程序我可以用来“附加”这个序列到对齐，并 ...

2024-10-02 已阅读: n次

他说我必须签下文件，例如：文件1.txt Seqname1 Seqname2 Seq1(+) SeqA Seq2(-) SeqA Seq3(+) SeqB Seq2(-) SeqC Seq8(-) ...

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