Python中的类常量字典我正在构建一个具有类变量字典的模块: class CodonUsageTable: CODON_DICT={'TTT': 0, 'TTC': 0, 'TTA': 0, 'TTG': 0 ...2024-09-29 已阅读: n次
Python计算具有多个键的值的所有实例跳转到编辑以获得更好的解释! 我已经试着解决这个问题好几个小时了,我的头都痛了(特别是因为我之前已经解决了,但不记得是怎么解决的,我用我的解决方案的脚本存储在学校的一台计算机上)。在 好吧,这就是我的 ...2024-09-29 已阅读: n次
在python中使用包含1个以上变量的for循环我正在写一个程序,我想在我的for循环中使用3个变量,并且每个变量都应该从不同的开始索引运行。这是我的代码片段。我有一个名为codons的表,其中每三个字母都有一些值,例如'atg':'F','ggg ...2024-09-29 已阅读: n次
在每个新的lin将一个列表放入一个列表中我正在尝试为每组kmer创建一个新列表(在列表中) 例如它应该返回: [['ATT', 'TTT', 'TTG', 'TGG', 'GGC'], ['TGC', 'GCC', 'CCT', 'CTT' ...2024-09-29 已阅读: n次
更新数据帧中的单元格会改变整行吗?我的数据框架由DNA序列组成,每列包含3个碱基,代表密码子。我的目标是在给定的条件下,将任何包含某个字符串的密码子更新为间隙。示例条件,如果我的密码子列表中的任何终止密码子出现在小于某个百分比的列中, ...2024-09-29 已阅读: n次
如何组合周期序列我有一个DNA序列,像CCG ACG GCA CTG GGC CAG TTG 我想在不改变每个子集的顺序的情况下,对这个序列进行所有可能的组合(比如说CCG应该是CCG)。 例如 修改后的序列可以是 ...2024-09-29 已阅读: n次
如何在Python中从一个字符串中找到多个子字符串例如,如果我有一个字符串“atgaggatagaggttgggagagatgagagaggatagaggatgatg” 我必须得到ATG和TTG之间的子串,因为我们可以看到在一个字符串中有两个这样的子 ...2024-09-29 已阅读: n次
制作str.查找函数 我一直在努力创造str.查找方法一个函数,我正在做的一堂课,我不太确定它是怎么做的。如果有人能帮我,请帮我。如果有帮助的话,我正在运行python2.7。我试图在一个更大的序列中找到一个子序列,以及 ...2024-09-29 已阅读: n次
如何将字节添加到一起并根据python中的校验和验证它们如何计算传入字节的校验和以查看它是否是有效数据包? 目前,我正在读取字节并对其进行解码并接收信息,但在此之前,我希望能够根据校验和对其进行验证,以确保不会收到任何无效/损坏的数据包 这是我目前拥有的 ...2024-09-29 已阅读: n次
代码循环不正确这个代码应该以一个更大的序列(称为sequentie)打印所有的编码序列。 但是它正在无限地打印第一个找到的序列。你知道吗 def getCodons(sequentie): DNA = se ...2024-09-29 已阅读: n次
字典结合了python我想合并两本字典。找了一点,但还没找到。因为我不知道它叫什么。 但我有两个口述: 数字1: Counter({'gag': 19, 'ccc': 15, 'cct': 15, 'ctg': 15, ' ...2024-09-29 已阅读: n次
计算蛋白质序列的所有可能的RNA密码子组合我有一个蛋白质序列: sequence_protein = 'IEEATHMTPCYELHGLRWVQIQDYAINVMQCL' 以及每种蛋白质的tRNA密码子表: codon_table = { ...2024-09-29 已阅读: n次