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Python strand
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关于strand 相关联的Python项目和问题:
最新问答
我需要帮助,以便根据条件和另一个数据帧添加新列。我知道难度很大,但我尽量添加了最多的示例,并修改了一个简单的算法,以满足我的需要
以下是我们将添加列的主要数据框:
df1
Name st ...
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我正在尝试获取python中嵌套列表中元素的索引-例如[[a, b, c], [d, e, f], [g,h]](并非所有列表的大小都相同)。
我试过用
strand_value= [x[0] for ...
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我正在尝试使用列表从Pandas数据帧中提取行,但无法完成。下面是一个例子
# df
alleles chrom pos strand assembly# center protLS ...
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我有一份格式如下的文件
QUERY: STBZIP38
Length of Query Sequence: 2000 bp | Nucleotide Freque ...
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我在重叠基因组区间问题的上下文中使用data.table::foverlaps。
我最近开始尝试在Python中找到foverlaps的等价物,因为每次我需要挖掘分析输出时,最好只使用一种语言,而不是 ...
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我是python的初学者,当时正试图找到一种方法,从csv文件中创建一个名称目录和一个值列表。我在网上发现了这个代码。这是可行的,但我一点也不懂
任何帮助都将不胜感激
我感到失落的主要领域是for循环 ...
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这是我有的,但似乎有点多余。也许在Python方面更有经验的人知道如何解决这个问题?应该很清楚它的作用。
def complementary_strand(self, strand):
...
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我有两份资料档案。我需要合并/联接给定列中相同的两个文件中的行。在
文件A:
#chr #start #end #gene #0 #strand
chrM 3307 4 ...
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我在学Python。我从单元测试开始:
import unittest
from rna_transcription import to_rna
class RNATranscriptionTes ...
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我想知道在python中将长格式数据解析为wide for的最佳方法是什么。我以前在R中做过这类任务,但我的文件可以达到1GB以上,确实需要很长时间。以下是一些虚拟数据:
Sequence Posit ...
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我有一个包含15列的表格文件,我想在循环中为该文件的每一行执行2个awk命令(我正在python脚本中生成许多其他函数,因此这些awk命令应该在我的脚本中)
#!/usr/bin/python3
i ...
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我在做一个分析PSL文件的项目。这个程序总体上看readpairs并识别循环分子。我已经让程序正常工作了,但是我的操作是嵌套的,这使得读取整个PSL文件的时间非常低效,需要10分钟以上,而不是15秒。 ...
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最新项目
以前是各种肽数据集的存储库,现在只包含
Immune Epitope Database和各种
氨基酸性质矩阵。这个包裹可能最终
拆分并将iedb部分放入名为pyiedb的文件中。
氨基酸特性
amin ...
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卡森
这是卡森方程的一个实现,一个数学模型
用于推导交流传输的等效阻抗或
配电线路。
实施
carsons是使用对Unicode字符的Python3.6支持开发的
像π,_,ρ,μ,ω等。 ...
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用于扩展或压缩fastq文件的串锚regex
此包Python名称:strandex
目前版本: strandex 0.4.1
最后 ...
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