生物ython对pdb残基数重新编号的后效应在下面的代码中,我解析了pdb并使用DSSP库计算了二级结构。在分析和存储值之后,我重新编号了留数,但没有修改_pdb和{}实例。在重新编号之后,它还重新编号了之前分配给_dssp的值,就像您在我注释 ...2024-05-17 已阅读: n次
捕获外部库引发的(特定的)泛型异常我使用的是一个外部库,它在某些情况下会在其中一个模块中引发泛型Exception: if some_condition: raise Exception('DSSP failed to pro ...2024-05-17 已阅读: n次
如何正确初始化PDB.DSSP对象我正在尝试获取PDB文件的DSSP,但python正在抛出未找到的文件 我从Windows的Ubuntu下载了dssp。 在ubuntu终端中调用哪个dssp会给出“/usr/bin/dssp” 使用 ...2024-05-17 已阅读: n次
安装xssp(DSSP的新版本)时出错我正在尝试安装xssp 3.0.9。我已成功下载并解压缩文件。但是配置和构建xssp可执行文件失败,并显示错误消息。对于命令,./autogen.sh运行没有问题,但是对于命令,./configure ...2024-05-17 已阅读: n次
无法获取设置交集抱歉,我的双重帖子,如果我不能让事情工作,我会更新这个问题:) 我正在比较两个文件。我将列出两个文件内容: File 1 File 2 "d.c ...2024-05-17 已阅读: n次
如何在类属性中迭代?所以,我有这个密码 import itertools def parse_dssp(dsspfile): dssp={} fdssp=open(dsspfile) ...2024-05-17 已阅读: n次
索引器错误:列表索引超出范围错误,如何修复代码?import os import sys import numpy as np from proteinss import ProteinSS map_dssp_3_alphabet = { ...2024-05-17 已阅读: n次
DSSPparser#dsspparser [![pypi-version](https://img.shields.io/pypi/v/DSSPparser.svg?style=flat)](https://pypi. ...2024-05-17 已阅读: n次
AMPAL振幅 一个简单,直观和Python的框架,用于表示生物分子结构。 安装 您可以从pip安装ampal: pip install ampal 或从源代码下载/克隆此存储库,导航到该文件夹 然后输入 ...2024-05-17 已阅读: n次