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Python intron
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关于intron 相关联的Python项目和问题:
最新问答
各位。
这个问题已经被其他人问过了。
Splitting dictionary/list inside a Pandas Column into Separate Columns
我已经问过这个问题了 ...
已阅读: n次
给定这样的数据帧
chrom first_bp_intron last_bp_intron unique_junction_reads
chr1 100 200 10
chr1 10 ...
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这段代码在文本文件中使用一行代码(该部分工作正常——感谢您的帮助)。但如果这一行中没有满足某个条件(如果它不包含“Intron”或“Exon”一词),则应该跳到下一行并重复该操作。
dataFile ...
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我认为用一个例子来解释我的困境是最好的方法。假设我有一个包含以下信息的文件:
isoform snp_rein
NM_005101 97
NM_005101 144
NM_19857 ...
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我解释我的问题。在
我实际上有一个gff文件(Augustus输出)
在这个gff文件中,我有不同支架中基因的定位,例如:
# Predicted genes for sequence number ...
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我有一个包含两列的数据集:
十进制数
一根长长的绳子
我想从第二列中提取每个FBtr编号(例如FBtr0072798),忽略其余的。你知道吗
0.850359 EFF=INTRON(MODIFI ...
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我有这样一个数据帧:
CCDS Size gene exonCount
10804 NM_001320648_exon_4_0_chr21_44515804_r 50 ...
已阅读: n次
我有两个文件都是制表符分隔的。其中一个文件几乎是800k行,它是一个Exonic坐标文件,另一个文件几乎是200k行(它是一个VCF文件)。你知道吗
我正在用python编写一个代码来查找和过滤VCF ...
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我正在尝试创建一个由多个词典组成的词典。我是从一个.txt文件创建的:
chrY 6 8 +
chrY 3 5 +
chrX 10 11 +
chrX 13 15 -
我想要的结果是:
{'chrY ...
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我被这个问题困扰了一段时间,所以我想我可能会寻求帮助
我有一系列文件,每个文件的结构如下:
I:8859_VEP upstream_gene_variant Y74C9A.2a.1
I:8859 ...
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我有一个如下的数据帧df["Annotations"]
missense_variant&splice_region_variant
stop_gained&splice_region ...
已阅读: n次
我有两个数据帧
df1
IMPACT Rank
HIGH 1
MODERATE 2
LOW 3
MODIFIER 4
df2[“注释”]
Annot ...
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最新项目
预测人类内含子单核苷酸的致病概率。
此包Python名称:regsnp-intron
目前版本: regsnp-intron 0.1.5
...
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介绍保留实用程序
从rna测序数据计算全基因组内含子保留事件的软件。
依赖性
Python
pysam>=0.9.0,^{}包。
软件
bedtools,hstlib
安装
pip inst ...
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