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Python alleles
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关于alleles 相关联的Python项目和问题：
最新问答
我必须重新格式化遗传学软件的数据，该软件要求将每一列分成两列，例如0-> G G; 1-> A G; 2 -> A A;。输出文件应该是制表符分隔的。我想在熊猫身上做：
import ...
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我是个初学者，这里有一段代码：
alleles=['DPY','DPX']
n_dict={'DPY':[['AA561_P4',5781],['AA562_P2',5712]],'DPX':[['A ...
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我正在尝试使用列表从Pandas数据帧中提取行，但无法完成。下面是一个例子
# df
alleles chrom pos strand assembly# center protLS ...
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上下文：大家好，请看这个问题。我是一名初级python程序员（两周内表现出色！）我相信我最初设计的课程很糟糕，我正在寻求帮助，寻找一个好的方法来重新设计基础课程（在Locus.py中）
背景：到目前 ...
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我有一个数据帧，它包含一个主要是NaN的，但某些条目中也有字典。我的目标是将这些字典扩展到数据帧的列，并将它们的条目保留在各自的索引中。
这就是数据帧的一小部分。在
...
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我试着做一个模拟，看看人口固定的速度有多快。总体由1（或p）和0（或q）组成，而每个个体有2个元素（1-1、1-0或0-0）。你知道吗
N是人口，由于人口的每个成员有2个元素，人口池将是2*N（在本例 ...
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我创建了上面的脚本来从数据库中删除不需要的基因。如果您只使用一次，它确实工作得很好，但是我重新运行它，它会给我一个错误消息，例如：
shutil.错误：目标路径'path/rejected\u dat ...
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我有一个代码，如下所示，它由一个with块组成。你知道吗
alleles=[]
pop = 1 + 4
snp=[]
# read in input file
with open("input.txt ...
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我刚刚开始学习python来解析一些变量调用格式（variant calling format，VCF）。一个简短的文件格式如下（来自wiki）：
我从here看到的线条是：
alleles = se ...
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这是我的第一个python脚本。我的数据如下：
Position ind1 ind2 ind3 ind4 ind5 ind5 ind7 ind8
0 C A C A ...
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Python 2.7版
给定alleles列表和数组长度numb_alleles，例如：
alleles = [11, 12, 13, 14, 15, 16]
numb_alleles = 8
我一 ...
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我试图在索引上合并两个熊猫数据帧，但我得到错误。。。在
这是df1
alleles chrom pos strand assembly# center protLSID ass ...
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最新项目
mhctools
运行命令行和基于web的mhc绑定预测程序的python接口。
命令行示例
预测用户提供的肽序列
mhctools --sequence SIINFEKL SIINFEKLQ ...
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快乐者
Daniel Standage，2018年
https://github.com/bioforensics/happer
happer是生成完整单倍型序列的最小Python库。
给定一个参考序 ...
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