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关于seqid 相关联的Python项目和问题：

目标是：在argparse中取一个参数检验这个论点是否成立如果为true，则使用该参数后指定的名称编写一个文件例如：在命令行中： $ python printfile.py --o ...

2024-05-17 已阅读: n次

我运行了下面的代码并比较了write2gff和run方法中的mrnas。结果是run方法中的mrnas包含1个list元素。另一方面，write2gff方法中的mrnas包含0个list元素。请参阅以 ...

2024-05-17 已阅读: n次

我正在构建一个查询字符串。在 query = "SELECT seqid, date, name, steamid, team, text, type, '%s' as triggerword, '% ...

2024-05-17 已阅读: n次

{1美元^ class Entries(ndb.Model): description = ndb.StringProperty() seqid = ndb.IntegerProperty() ...

2024-05-17 已阅读: n次

我是python的新手，尽管我尽了最大的努力来理解I/O和文件处理，但我还是很难理解为什么我的程序不能打印。你知道吗下面的代码应该接收一个fastQ或fasta文件（用于DNA或蛋白质序列）并根据用 ...

2024-05-17 已阅读: n次

我在删除Fasta文件中的所有空格时遇到问题，以下是我目前使用的程序： import re for line in f: line = line.rstrip(' \n\r') ...

2024-05-17 已阅读: n次

我试图迭代几个列表，并找到一个项目是否存在于其他列表中。这是我的密码： with open("Busca1.txt", "r") as f, open("CELLO1.txt","r") as f1 ...

2024-05-17 已阅读: n次

我有一个python词典列表。字典包含我需要为所有字典更新的“sequenceId”，确保每个sequenceId是均匀的且不可重复。为了更新SequenceID，我使用了一个for循环，但其行为并 ...

2024-05-17 已阅读: n次

我试图在输入文件中仅打印序列id，而不是整个描述行，以及fasta文件中它旁边的GC内容，例如： Seq1 40% Seq2 37% Seq3 12% 当我运行这段代码时，什么都没有发生 ...

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我尝试在字符串中使用表达式source {15}(\d+){2}\n，如下所示 ''' FEATURES Location source 1. ...

2024-05-17 已阅读: n次

我尝试在CNTK中实现LSTM（使用Python）来对序列进行分类。在输入：特征是固定长度的数字序列（时间序列）标签是一个热值的向量网络： input = input_variable(i ...

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我仍然是一个新手开发没有多少时间在我的腰带与这个。我构建了一个.csv文件，其中包含设备ID、设备序列和序列的NSN。我有一个.csv文件，它包含了facility、sequence和NSN的所有可能 ...

2024-05-17 已阅读: n次

深度统计 1简介 depth_stat是一个从深度文件中提取序列深度并进行一些统计的工具。见https://github.com/linzhi2013/depth_stat。 2安装 pip ins ...

2024-05-17 已阅读: n次

#小型双工工具生物信息学的几个小功能 #smallbixtools为生物信息学提供一些小功能。有关详细信息，请参阅自述文件。回购地点： https://bitbucket.org/hivdive ...

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