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Python imagej
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关于imagej 相关联的Python项目和问题：
最新问答
我应该使用什么函数（以及如何使用它们）来裁剪出图像的中心部分？我只想取不太密集的部分，而不是密集的边界。你知道吗
谢谢！你知道吗
最后，我想计算区域中的微小圆/点（细胞），或者计算第二张图中所示的较不 ...
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我正在寻找Python中半自动阈值的解决方案。skimage或类似软件包是否有预先构建的灰度阈值范围供选择？我已经包括了我想复制的imageJ阈值 ...
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我正在处理我拍摄的一些细胞的Z-stack图像。我想投影这些图像，类似于ImageJ中的ZProjection函数。你知道吗
在导入它们（见下文）之后，我有了一个3d图像堆栈。我继续在3/Z维上执行n ...
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编辑注释：
这个问题最初的措辞是
如何链接简单点。表演（）到linux中的imageJ？在
通过将simpleitk1.0.0升级到1.0.1，我可以从简单点。表演(). 但是，ImageJ无法打开“ ...
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我试图用tifffile.imsave文件. 对于1、2或>；=5张图像，此方法非常适用。但是，如果我尝试在一个堆栈中保存3或4个图像，图像读取器（如ImageJ）会将图像分别解释为rgb通道， ...
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我正在使用ImageJ和scikit image来分析3D图像。
我的原始图像是16位的，它非常大。我在imageJ中将16位图像转换为8位图像，以便轻松工作。
我现在只显示16位图像和16位scik ...
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我为Fiji ImageJ（1.52n）写了一个宏来分析粒子。
除此之外，我还编写了一个python（3.7）代码，用于处理粒子分析中的结果数据。在
我希望在Python代码中实现ImageJ宏——所 ...
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我有一个python库，它主要围绕单个图形应用程序。我本打算生成二进制文件，这样人们就不需要安装python来使用它，但是由于各种原因，这样做并不那么简单。因此，我试图想出一种最省事的打包方式，这样非 ...
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我正在探索pyimagej（Python的imagej）在windows10平台上的使用。我无法打开到imagej的网关，并怀疑我的conda环境可能有问题。在
我遇到的问题和别人发的问题是一样的图像 ...
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我试图在ImageJ中安装一个Python脚本。我的首选是在imagej1.x中使用脚本，但是如果需要，可以使用Fiji
我试图将脚本与ImageJ 1.x一起使用，方法是将它放在plugins文件夹 ...
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我正在使用Python设计一个软件，图像处理是其中的一个步骤。我用ImageJ来实现这一点。
由于ImageJ中有一个Jython解释器，可以在ImageJ软件中打开，因此必须有一种方法将ImageJ ...
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我正在尝试从python3.7中打开“imageJ”图像处理工具，并向其发送命令，其中包含操作系统和子流程模块。我只能打开“imageJ”应用程序，但无法向其发出任何进一步的命令，如“导入图像序列、处 ...
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最新项目
图像
rawimage是以原始格式读取和写入图像（数据数组）的包，以便imagej可以轻松地读取它们。
安装
安装最新版本的最简单方法是使用pip:
$ pip install rawimag ...
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图像处理框架基于像imagej这样的插件，很容易与scipy.ndimage、scikit image、opencv、simpleitk、mayavi…和任何基于numpy的库结合在一起 ...
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摘要
Python／C++端口，由菲利普·戴维纳斯/ EPFL编写。
用于将源图像或堆栈（电影）自动对齐到目标图像/参考帧的python扩展。
说明
pystackreg用于将一个或多个图像与 ...
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imagej的python包装器
^{}提供一组
用于imagej和python之间集成的包装函数。
它还提供了一个高级入口点imagej.IJ，用于调用
ImageJ Server原料药；
有关详细 ...
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图像处理框架基于像imagej这样的插件，很容易与scipy.ndimage、scikit image、opencv、simpleitk、mayavi…和任何基于numpy的库结合在一起 ...
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皮科斯坦扎
pycostanza是对imagej工具costanza的python重写。它包括
用于分割图像中对象（例如细胞核或整个细胞）的特征
基于强度梯度。
自由软件：GNU通用公共许可 ...
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μmanager是一个用于自动成像和控制的开源软件包
多平台（Windows、Mac和Linux）上的显微镜。一起
imagej是一个流行的图像处理包，μmanager提供了一个全面的
成像解决方案- ...
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作者：弗拉基米尔·施泰恩
github：[github]（https://github.com/mistervladimir）
linkedin：[linkedin]（https://www.link ...
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阅读投资回报率
读取用imagej生成的roi文件.zip或.roi。代码主要来自：http://rsb.info.nih.gov/ij/developer/source/ij/io/RoiDec ...
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imagej的python工具
此包Python名称：PymageJ
目前版本： PymageJ 0.1
最后维护时间：Jul 25 ...
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ijroi
将ImageJroi读入numpy数组。使用
就像：
>>> import ijroi
>>> with open("my_roi.roi", "rb ...
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imagej的python包装器
^{}提供一组
用于imagej和python之间集成的包装函数。
它还提供了一个高级入口点imagej.IJ，用于调用
ImageJ Server原料药；
有关详细 ...
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