从列表列表中的字符串中查找和拆分字符我已经做了几天了,尝试了各种不同的方法,检查了至少50个不同的stackoverflow/python库/python新闻组问题,没有一个能提供太多帮助。(尽管如果它在外面,而我错过了它,我也不会感到 ...2024-05-19 已阅读: n次
python中的基本数据格式我想格式化一个有7000个条目的文本文件,并使用下面的代码来排序。但最近几周,我遇到了一个问题: (输入数据如下) 用户\蛋白质\ ID=P25358 SMART|蛋白质|ID=uniprot | P ...2024-05-19 已阅读: n次
如何使函数返回所有可能的值所以我正在使用这个方法,它可以很好地查找数字,但它只返回最后一个值。有没有办法让它在每次运行后返回所有值。 这是我的密码: def searchPFAM(): fileAddress = ' ...2024-05-19 已阅读: n次
有没有办法计算出我的收益率有多少?我想知道在我创建一个新的file.txt之前有没有办法找出多少对值(start,end)。我的目标是检查我是否开始,结束值超过一对,然后我想为每一对创建单独的文件。如果没有,那就保持原样。你知道吗 d ...2024-05-19 已阅读: n次
Python:用来自anoth的数据填充数据帧我有一个空的熊猫数据框,如第一张图片所示。你知道吗 我喜欢什么first dataframe 因此,许多Pfam id作为列,许多不同的基因id作为索引。然后我有第二个这样的数据帧。 second d ...2024-05-19 已阅读: n次
这个脚本中的Python正则表达式实现我想解析一个大的文本文件,它是用换行符“//”分割的。我的输入文件如下: ID HRPA_ECOLI Reviewed; 130 AA. AC P433 ...2024-05-19 已阅读: n次
反mash下载_数据库.py子进程出错我试图在我的研究小组的服务器上安装antiSMASH,但在下载相关数据库的最后阶段遇到了一个问题。制造商提供了一个脚本“下载”_数据库.py“为您执行此操作(请参见位于https://bitbucke ...2024-05-19 已阅读: n次
使用two for循环在python中迭代两个大列表。什么都没发生我想使用two for循环来迭代两个大的列表,但是不会发生任何情况。 这是密码 pfam = open(r'D:\RPS_data\pfam_annotations.tbl', 'r') number ...2024-05-19 已阅读: n次
在python中,有没有更快的方法通过另一列搜索一列的每个值?我需要搜索一列的每个值,与另一列的所有条目进行比较,如果满足某些条件,则打印。我正在使用下面的python代码,它可以工作,但缺点是这两列都有上万个条目,所以速度非常慢。有没有更有效的方法 for i ...2024-05-19 已阅读: n次
如何在数据框的列中列出唯一的名称? 我想在Pfam_domains列中检索至少一次提到的所有名称 这是我的数据框: TCID Fonction Genbank Uniprot Pfa ...2024-05-19 已阅读: n次
python.readlines()utf8/latin1编码我正在写一个程序,其中粘在一起一些hh套件程序。。。但我遇到了一个非常奇怪的问题-当脚本必须.readlines()时,它会依次在一个文件上停止,并出现错误unicodedecodeerror: 'u ...2024-05-19 已阅读: n次
在一个变量中存储2个值?我想知道,有没有一种方法可以在main方法上存储起始值和结束值。我试着这么做,但它给了我一个错误: def searchM(): fileAddress = '/database/pro/d ...2024-05-19 已阅读: n次
bio2bel-pfam 安装 bio2bel_pfam可以从 PyPI 在您喜爱的终端中使用以下代码: $ python3 -m pip install bio2bel_pfam 或者来自GitHub上的最新代码,使用: ...2024-05-19 已阅读: n次
orphHCA 欢迎来到orphca的web存储库! 有关最新文档,请参见: http://orphhca.readthedocs.org/en/latest/index.html 快速安装指南: 下载拉链后 ...2024-05-19 已阅读: n次
deepbgcdeepbgc:生物合成基因簇检测与分类 deepbgc利用深度学习检测细菌和真菌基因组中的bgc。 deepbgc采用双向长短期记忆递归神经网络 以及一种类似于word2vec的pfam蛋白结构域载 ...2024-05-19 已阅读: n次
pfamserver[![故事就绪](https://badge.waffle.io/ecolell/pfamserver.png?label=ready&title=Ready)](https://waffle ...2024-05-19 已阅读: n次
domain-classifier域分类器-使用pfam域将序列分类到其分类域 安装 pip安装域分类器 如何使用 输入通常是一个dna fasta序列,它将被翻译成蛋白质,并搜索pfam结构域。这些结构域将用于将每个序列分为四个结构 ...2024-05-19 已阅读: n次